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茶树细胞信号调节基因家族功能解析与相互作用研究

目录

一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2国内外研究进展综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.4技术路线与创新点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.5论文结构安排．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

二、研究材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.1.1茶树品种与来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

2.1.2试剂与仪器设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.2.1基因家族成员的鉴定与序列获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.2.2生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.2.3基因表达模式检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2.4蛋白互作网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.2.5酵母双杂交验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

三、茶树细胞信号调节基因家族鉴定与特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．37

3.1基因家族成员的识别与命名．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

3.2基因结构域与保守基序解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

3.3系统发育关系构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.4染色体定位与基因复制分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

3.5启动子顺式作用元件预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

3.6亚细胞定位与理化性质推测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

四、基因家族成员表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

4.1不同组织中的表达特异性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

4.2非生物胁迫下的响应表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

4.3激素处理后的表达动态．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

4.4发育阶段的表达差异．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．63

4.5转录因子结合位点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

五、基因家族成员相互作用网络解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69

5.1蛋白质互作数据的获取与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．70

5.2互作网络的拓扑学特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71

5.3关键枢纽基因的识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74

5.4互作模块的功能富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76

5.5互作验证实验设计与结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79

六、关键基因功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．85

6.1候选基因的克隆与载体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．86

6.2遗转体系的建立与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．89

6.3表型分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．