油麻藤叶绿体基因组密码子使用偏性分析.pdfVIP

特产研究SpecialWildEconomicAnimalandPlantResearch137

DOI：10.16720/ki.tcyj.2025.153

油麻藤叶绿体基因组密码子使用偏性分析

邬艳，周胜珍，周艳雪，杨唯香，赵月梅※

（贵州师范学院生物科学学院，贵州贵阳550018）

CodonWCUSPSPSS

摘要：为了研究油麻藤叶绿体基因组密码子偏好性的使用模式。本研究用、和等软件对油麻藤叶绿体基因组

50CDSGC26.17%A/U

的条序列进行分析。结果显示，油麻藤叶绿体基因组密码子3含量最低，为，表明该植物密码子偏向以结

ENC46.53GCGCENC-plot

尾；有效密码子数（）平均值为，表明该植物密码子整体偏性较弱；中性分析中12和3相关性显著，分析中

46%ENC－0.05~0.05PR2-plotGTCA3

的值分布于的区间，分析中和的使用频率高于和，上述种图形分析均显示油麻藤叶绿

UUAUUU20

体基因组密码子使用偏性受突变和选择两个因素的影响，和等个密码子为最优密码子。

关键词：油麻藤；叶绿体基因组；最优密码子；密码子偏性

S682A1001-4721202504-0137-08

中图分类号：文献标识码：文章编号：（）

CodonUsageBiasofChloroplastGenomeinMucunasempervirens

WUYan,ZHOUShengzhen,ZHOUYanxue,YANGWeixiang,ZHAOYuemei※

(SchoolofBiologicalSciences,GuizhouEducationUniversity,Guiyang550018,China)

Abstract:ToanalyzetheusagepatternofcodonbiasinthechloroplastgenomeofMucunasempervirens.Inthisstudy,50proteincoding

sequencesofM.sempervirenswereanalyzedusingCodonW,CUSPandSPSSsoftware.TheresultsshowedthatthecontentofcodonGC3

inthechloroplastgenomeofM.sempervirenswasrelativelylowwith26.17%,indicatingthatthecodonstendtoendinA/Usequence;the

averageENCvalueis46.53,indicatingthattheoverallcodonbiasofthe