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山羊TLR4基因的生物信息学分析

雷国栋1,曾亚英²,刘树梅3,涂雷4,王子奥5*

（1.湘西土家族苗族自治州畜牧水产事务中心，湖南吉首416000；2.阿拉善盟农畜产品质量安全中心，

内蒙古阿拉善750306；3.龙山县桂塘镇农业综合服务中心，湖南吉首416817；4.龙山县畜牧兽

医技术推广服务中心站，湖南吉首416899；5.湖南生物机电职业技术学院动物科技学院，湖南

长沙410127)

摘要：为研究山羊Toll样受体4(TLR4)基因的结构与功能，本试验利用生物信息学方法对山羊TLR4

基因核苷酸的相似性、氨基酸序列、蛋白理化性质、蛋白质结构和互作蛋白等进行分析。结果表明：山羊

TLR4基因共编码641个氨基酸，为碱性亲水性非稳定蛋白，其中亮氨酸含量最多，占15.6%；山羊

TLR4蛋白的分子式是C3334H5245NsiOg42S28，分子质量为73640.34u，等电点为8.23；多肽链中以无规则

卷曲为主，第454~641个氨基酸在膜内，属跨膜蛋白；蛋白互作表明，山羊TLR4蛋白可能通过介导脂

多糖(LPS)等与Toll样受体家族2(TLR2）、白细胞分化抗原14(CD14)、肿瘤坏死因子受体相关因子6

(TRAF6)和髓样分化因子88(MYD88)等蛋白发生作用，从而参与核因子-kB(NF-kB）、丝裂原活化蛋

白激酶(MAPK)和非受体酪氨酸激酶(Src)等信号通路在脂代谢、炎症及生殖免疫等方面发生作用。

关键词：山羊；TLR4基因；生物信息学；分析

中图分类号：S827文献标识码：A文章顺序编号：1005-5959(2024)06-003-05

Toll样受体(toll-likereceptors,TLRs)是机体内析，具体软件或工具见表1。

重要的模式识别受体，具有先天性免疫作用。在Toll2结果与分析

样受体家族中,Toll样受体4(TLR4)表达于细胞表面[2],2.1山羊TLR4基因进化树

TLR4基因可激活脂多糖(LPS)信号转导，从而在细胞通过MEGA7.0与GenBank数据库中9个物种

增殖和调亡中发挥作用[3]。TLR4基因还可以通过识别的核苷酸序列进行比对，构建系统进化树，发现山羊

革兰阴性菌细胞壁上的LPS进行信号传导，促进核因TLR4基因与四川羚羊亲缘关系最为接近，然后依次是

子-kB(NF-kB)蛋白核内相关基因转录,从而发挥早弯角大羚羊、河马、绵羊及野马，而与野水牛、家牛和瘤

期免疫作用4。TLR4基因表达水平和多态性与呼吸道牛等的亲缘关系较远，与大额牛的亲缘关系最远，可见

肺炎5]、胃炎[等疾病密切相关。山羊TLR4基因在物种间有较高的保守性（图1)。

在山羊中,TLR4基因的不同基因型还与抗呼吸2.2山羊TLR4蛋白理化性质分析

道感染的遗传潜力相关。为深人探究山羊TLR4基ProtParam分析结果显示，山羊TLR4蛋白的分子

因的结构和功能，本研究通过生物信息学分析山羊式是C334H5245Ns8i0Og42S28，相对分子质量为73640.34u，

TLR4基因序列、理化性质、跨膜结构、亚细胞定位及理论等电点为8.23，不稳定系数计算为41.04，将山羊

蛋白互作网络等，为进一步探讨山羊TLR4基因功能TLR4蛋白归类为不稳定蛋白；亲水性总平均值

提供依据。(GRAVY)为-0.012,说明山羊TLR4为亲水蛋白；山

1材料与方法羊TLR4蛋白半衰期在哺乳动物网织红细胞中为

1.1山羊TLR4基因序列30h,在酵母中半衰期20h,在大肠杆菌中10h。由表

山羊TLR4基因序列来源于NCBI数据库，登录2可知,山羊TLR4蛋白的氨基酸个数为641个,其中

号为LC463030.1。占比最多的3种氨基酸分别为亮氨酸(Leu)、丝氨

1.2山羊TLR4基因的生物信息学分析