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中国农业科学2024,57(7):1308-1318
ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2024.07.008
开放科学(资源服务)标识码(OSID):
玉米ACO基因家族生物信息学及表达模式分析
1121111
王程泽,张燕,付伟,贾京哲,董金皋,申珅,郝志敏
1河北农业大学生命科学学院/华北作物改良与调控国家重点实验室/河北省农业微生物生物信息利用技术创新中心/河北省植物生理与分子病理学重点
2
实验室,河北保定071000;邯郸学院,河北邯郸056005
摘要:【目的】对玉米1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶ACO基因家族进行全基因组鉴定,分析其在玉米不同器官和不同发育
时期以及响应外源激素和病菌侵染中的表达模式,为明确玉米ACO基因家族功能打下基础。【方法】利用生物信息学方法,
在玉米B73自交系基因组中鉴定ACO,对其基因结构、蛋白质理化性质、家族成员间的亲缘关系以及保守基序进行分析,
利用实时荧光定量PCR(real-timefluorescencequantitativePCR,qRT-PCR)技术分析ZmACO基因家族的表达模式。
2+
【结果】除ZmACO11外,ZmACO家族成员均具有Fe离子结合位点和底物抗坏血酸结合位点。系统发育分析显示,ZmACO2
与ScACO在同一分支,亲缘关系较近,Bootstrap值达98。基因表达分析表明,ZmACO2、5、9、15、20、35在各发育时
期均活跃表达,且在叶片中呈优势表达,因此选择上述6个基因进行下一步检测。喷施乙烯利后,上述6个基因的表达
均有所波动,其中ZmACO2的表达量受影响较大,变化幅度在8倍左右。在乙烯利处理的0—24h内这6个基因的表达量
存在波动,但在处理后24h,6个基因的表达量均接近0。水杨酸处理后,ZmACO5的表达量受影响较大,变化倍数在2
倍左右。其他基因的表达量在处理后24h均接近0。ZmACO9、35在3—12h的表达量存在波动,ZmACO2、15、20表达量
呈下调趋势。在响应生物胁迫方面,接种玉米大斑病菌(Setosphaeriaturcica)后,ZmACO5、9的表达量变化幅度最大,
在接种后第10天,这两个基因的表达量分别升至对照组的50和60倍。接种玉米小斑病菌(
Cochlibolusheterostrophus)
后,ZmACO5的表达量变化幅度较大,变化倍数在40—90倍。接种立枯丝核菌(Rhizoctoniasolani)后,ZmACO5、35
表达量变化幅度最大,在病菌接种的第3天达到200倍。【结论】ZmACO2、5、20、35在玉米生长发育过程中表达变化最
活跃;施加外源乙烯利和水杨酸可以对ZmACO的表达水平造成显著影响。病菌侵染玉米后ZmACO的表达水平产生显著变
化,与生物胁迫应答关系密切。
关键词:玉米ACO基因家族;实时荧光定量PCR;基因表达;乙烯利;水杨酸;玉米大斑病菌;玉米小斑病菌;立枯丝核菌
BioinformaticsandExpressionPatternAnalysisofMaizeACOGene
Family
1121111
WANGChengZe,ZHANGYan,FUWei,JIAJingZhe,DONGJinGao,SHENShen,
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