高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析.pdfVIP

高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析.pdf

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湖南农业科学(HUNANAGRICULTURALSCIENCES)2024(7):7-14

沈红建等:高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析

引用格式:沈红建,邓锦清,廖柏勇,等.高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析[J].湖南农业科学,2024(7):7-14.

DOI:10.16498/ki.hnnykx.2024.007.002

 高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析 

  沈红建,邓锦清,廖柏勇,张碧佩,李永泉,王溢  

(仲恺农业工程学院,广东广州510220)

摘要:NAC转录因子是植物中特有的转录因子,其在N端含有一段高度保守的特异结构域,对植物生长发育、胁迫反应和

次生代谢产物生物合成等过程具有重要功能。研究基于高州油茶第三代全长转录组数据信息,通过生物信息学的方法筛选获

得51个NAC转录因子,为深入研究基因家族特征,对其进行理化性质分析、多列比对分析、蛋白系统进化树、保守基序和

基因结构分析、亚细胞定位,以及二级蛋白域结构预测、蛋白磷酸化位点分析。结果表明:NAC蛋白存在氨基酸数量差异,

且氨基酸序列间疏水性呈现为亲水性蛋白,其蛋白结构中具有5个保守的亚结构域。NAC转录因子系统进化树分析表明116

个基因可划分为10个亚族群,部分高州油茶NAC蛋白具有特异性聚为单一亚族群,其他与拟南芥和水稻融合为不同亚族群。

同时NAC蛋白均具有NAM超家族结构。亚细胞定位表明51个高州油茶NAC蛋白均位于细胞核,且二级结构中随机卷曲结

构为主,同时含有α-螺旋和β-转角结构等。蛋白磷酸化位点都具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)。

关键词:高州油茶;NAC转录因子;生物信息学分析

中图分类号:S565.4;Q943.2文献标识码:A文章编号:1006-060X(2024)07-0007-08

IdentificationandBioinformaticsAnalysisofNACTranscriptionFactorFamilyinCamellia

drupiferaLoureiro

SHENHong-jian,DENGJin-qing,LIAOBo-yong,ZHANGBi-pei,LIYong-quan,WANGYi

()

ZhongkaiUniversityofAgricultureandEngineering,Guangzhou510220,PRC

 NACtranscriptionfactorsareuniquetranscriptionfactorsinplants,whichcontainahighlyconservedsegmentofspecific

Abstract:

structuraldomainsattheN-terminusandhaveimportantfunctionsintheprocessesofplantgrowthanddevelopment,stressresponse,

andsecondarymetabolitebiosynthesis.Inthisstudy,basedontheinformationofthethird-generationfull-lengthtranscriptomedata

ofCamelliadrupiferaLoureiro(C.drupifera),51NACtranscriptionfactorswereobtainedbybioinformaticsscreening.Inorderto

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