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湖南农业科学(HUNANAGRICULTURALSCIENCES)2024(7):7-14
沈红建等:高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析
引用格式:沈红建,邓锦清,廖柏勇,等.高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析[J].湖南农业科学,2024(7):7-14.
DOI:10.16498/ki.hnnykx.2024.007.002
高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析
沈红建,邓锦清,廖柏勇,张碧佩,李永泉,王溢
(仲恺农业工程学院,广东广州510220)
摘要:NAC转录因子是植物中特有的转录因子,其在N端含有一段高度保守的特异结构域,对植物生长发育、胁迫反应和
次生代谢产物生物合成等过程具有重要功能。研究基于高州油茶第三代全长转录组数据信息,通过生物信息学的方法筛选获
得51个NAC转录因子,为深入研究基因家族特征,对其进行理化性质分析、多列比对分析、蛋白系统进化树、保守基序和
基因结构分析、亚细胞定位,以及二级蛋白域结构预测、蛋白磷酸化位点分析。结果表明:NAC蛋白存在氨基酸数量差异,
且氨基酸序列间疏水性呈现为亲水性蛋白,其蛋白结构中具有5个保守的亚结构域。NAC转录因子系统进化树分析表明116
个基因可划分为10个亚族群,部分高州油茶NAC蛋白具有特异性聚为单一亚族群,其他与拟南芥和水稻融合为不同亚族群。
同时NAC蛋白均具有NAM超家族结构。亚细胞定位表明51个高州油茶NAC蛋白均位于细胞核,且二级结构中随机卷曲结
构为主,同时含有α-螺旋和β-转角结构等。蛋白磷酸化位点都具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)。
关键词:高州油茶;NAC转录因子;生物信息学分析
中图分类号:S565.4;Q943.2文献标识码:A文章编号:1006-060X(2024)07-0007-08
IdentificationandBioinformaticsAnalysisofNACTranscriptionFactorFamilyinCamellia
drupiferaLoureiro
SHENHong-jian,DENGJin-qing,LIAOBo-yong,ZHANGBi-pei,LIYong-quan,WANGYi
()
ZhongkaiUniversityofAgricultureandEngineering,Guangzhou510220,PRC
NACtranscriptionfactorsareuniquetranscriptionfactorsinplants,whichcontainahighlyconservedsegmentofspecific
Abstract:
structuraldomainsattheN-terminusandhaveimportantfunctionsintheprocessesofplantgrowthanddevelopment,stressresponse,
andsecondarymetabolitebiosynthesis.Inthisstudy,basedontheinformationofthethird-generationfull-lengthtranscriptomedata
ofCamelliadrupiferaLoureiro(C.drupifera),51NACtranscriptionfactorswereobtainedbybioinformaticsscreening.Inorderto
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