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根系培育体系中作物抗逆性遗传标记的筛选方法研究

目录

文档概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.1根系培育技术发展述评．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.1.2作物非正常环境适应性问题探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.1.3抗逆性遗传标记筛选的必要性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.1根系形态功能研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.2.2作物抗逆生理机制研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

1.2.3抗逆相关性状标记开发动态．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

1.3本研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

1.3.1主要研究目的界定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

1.3.2具体研究内容安排．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.4技术路线与研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

1.4.1总体研究步骤设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

1.4.2实验实施方案概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

根系培育体系构建与抗逆性表型鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.1根系可控培育模式建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.1.1不同培育方法比较与选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.1.2培育体系关键参数调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.2抗逆性胁迫条件模拟．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.2.1非正常环境因子选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.2.2胁迫处理实施与控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.3抗逆性表型量化评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.3.1生理生化指标测定方案．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

2.3.2生长相关指标观察记录．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

2.3.3抗逆性综合表型评价体系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

抗逆性相关基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

3.1基于转录组水平的分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.1.1信使核糖核酸提取与质量检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

3.1.2高通量测序实施过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

3.1.3差异表达基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

3.2功能基因初步注释与富集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

3.2.1DEGs序列比对与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66

3.2.2基因本体富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68

3.3相关候选基因挖掘．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．70

抗逆性数量性状位点定位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72

4.1高密度遗传图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

4.1.1亲本群体设计与构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．77

4.1.2基因组高密度分子标记开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．