基于DNA条形码鉴别青葙子与鸡冠花子及其遗传多样性分析.pdfVIP

药学前沿2025年1月第29卷第1期73

·论著·一次研究·

基于DNA条形码鉴别青葙子与鸡冠花子及其

遗传多样性分析

宋 叶，李国卫，兰小勇，钟春琳，谭斯尹，刘闪闪，潘礼业，陈向东，孙冬梅

广东一方制药有限公司，广东省中药配方颗粒企业重点实验室（广东佛山 528244）

目的应用分子生物学鉴定技术，筛选出应用于鉴定青葙子与鸡冠花子的最

【摘要】

佳DNA条形码，建立快速、准确、便捷的青葙属植物鉴定方法。方法收集青葙子、鸡冠花

子样品共计21份，提取样品总DNA，对内部转录间隔区（ITS）、psbA-trnH、matK、rbcL

和trnL-trnF序列进行扩增和测序，采用MEGA-X软件对数据进行分析处理，计算Kimura-2-

parameter遗传距离，建立邻接聚类进化树，进行对比分析，基于TaxonDNA计算BestMatch、

BestCloseMatch以评估DNA条形码的鉴别能力，利用ITS2数据库和RNAfold数据库预测条形

码序列二级结构。结果条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列均扩增成功且具

有较高的测序成功率，其中psbA-trnH具有最多的变异位点，ITS次之。psbA-trnH、ITS2、

trnL-trnF具有较明显的条形码间隙，以psbA-trnH最为显著（100%）。系统进化树显示，

IITS、ITS2、psbA-trnH、matK、trnL-trnF序列均可将青葙子与鸡冠花子各自聚为一支，各分支

点的支持率均高于60%，以psbA-trnH、trnL-trnF的各分支点的支持率最高（99%）。分子方

差分析结果显示psbA-trnH序列的群体遗传分化指数最高，适用于区分青葙子和鸡冠花子物种

间差异。除matK外，青葙子与鸡冠花子psbA-trnH、ITS2、trnL-trnF序列的二级结构均有差异。

结论以psbA-trnH为主、ITS和trnL-trnF为辅，可实现青葙子和鸡冠花子的准确鉴定。

青葙子；鸡冠花子；DNA条形码；物种鉴定；遗传距离；系统发育树分析；

【关键词】

二级结构

R282.5A

【中图分类号】【文献标识码】

DNAbarcodescreeningandgeneticdiversityanalysisoftheCelosiaesemen

andCelosiacristataesemen

SONGYe,LIGuowei,LANXiaoyong,ZHONGChunlin,TANSiyin,LIUShanshan,PANLiye,

CHEN Xiangdong,SUNDongmei

GuangdongYifangPharmaceuticalCo.,Ltd.,GuangdongProvincialKeyLaboratoryofTraditional

ChineseMedicineFormulaGranule,Foshan528244,GuangdongProvince,China

Correspondingauthor:PANLiye,Email:panliye@

AbstractObjectiveToscreentheoptimalDNAbarcodeforidentifyingCelosiaesemen

【】

andCelosiacristataesemenusingthemolecularbiologyidentificationtechniques,andtoestablisha

rapid,accurate,andconvenientapproachforidentifyingspeciesintheCelosia