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—100—江苏农业科学2025年第53卷第4期
石远帅,陆俊,丁丹,等.烟草钾转运蛋白KUP基因家族鉴定与表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(4):100-110.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2025.04.012
烟草钾转运蛋白KUP基因家族鉴定与表达分析
石远帅,陆俊,丁丹,樊一丹,刘洋
(贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室,贵州贵阳550025)
摘要:烟草是我国重要的经济作物,对钾素需求量较大。KUP家族是目前已知的最大的钾离子转运蛋白家族,在
钾离子吸收和转运方面起着重要作用。对烟草KUP基因家族进行鉴定和分析,并探究其在低钾胁迫下的表达模式,
可为进一步研究和利用烟草KUP基因奠定基础。本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定KUP家族,且对
家族成员的理化性质、系统进化关系、保守基序、基因结构、共线性分析、K/K值、顺式作用元件等进行分析,并探明
as
KUP基因家族成员在根、茎、叶、花等不同组织及干旱胁迫条件下的表达模式;最后通过qRT-PCR方法分析其在低钾
胁迫下的表达模式。生物信息学分析结果显示:在烟草K326基因组中共鉴定出39个KUP基因,家族成员均含有一
个典型的“K_transsuperfamily”结构域,其中26个被定位在13条染色体上,存在7对共线性基因对,有3对基因对的
K/K值远远小于1,有1对基因对的K/K值大于1;KUP家族蛋白均为疏水性蛋白,其基因上游启动子区均包含多
asas
个激素和胁迫元件。转录组数据表明:NtKUP家族基因大部分成员在根和花中高表达,少部分在茎和叶中高表达,且
部分成员在花中表达量随着成熟度逐渐降低;大多数基因对干旱胁迫存在响应。挑选4个NtKUP基因进行qRT-
PCR分析,试验结果表明:KUP2、KUP4、KUP8在低钾胁迫下根中的表达量有不同程度的上调,且根中的表达量远远高
于叶,这和NtKUP家族大部分成员在根中参与低钾胁迫响应的生物信息学分析相一致。
关键词:烟草;KUP基因家族;钾转运蛋白;生物信息学;表达模式;低钾胁迫;干旱胁迫
中图分类号:S188;S572.01文献标志码:A文章编号:1002-1302(2025)04-0100-11
+
烟草(NicotianatabacumL.)是我国重要的经济白按结构可分为:KUP/HAK/KT(Kuptake/high-
++
作物,对钾素需求量较大,含量通常为氮素的1.4affinityKtransporter/Ktransporter)、HKT(high-
[1]+
倍、磷素的3.5倍。钾离子不仅能够满足烟草的affinityKtransporter)和CPA(cation-proton
生长发育需求,而且能够提高烟叶的品质,缺钾会antiporter,CPA)。KUP家族是目前所知的最大的钾
导致烟草代谢失调,光合速率下降,根系生长受抑离子转运蛋白家族,其成员最多,覆盖面最广,广泛
制,钾对于提烟叶产量、改善品质起着非常重要存在于各种植物的器官当中,在细胞膜和液泡膜上
[2][7]
的作用;研究表明,钾离子能够有效降低烟焦油起作用;KUP转运蛋白家族的共同特征是具有12
[3]个跨膜区域(TMS),在第2个和第3个TMS之间有
以及其他部分有害物质的含量,含钾高
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