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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术基于“边合成边测序”原理?
A.纳米孔测序(Nanopore)
B.焦磷酸测序(454)
C.单分子实时测序(PacBio)
D.桥式扩增测序(Illumina)
答案:D
解析:Illumina测序平台采用桥式扩增结合边合成边测序技术,通过荧光标记的dNTP掺入并读取信号;A为纳米孔技术(电信号识别),B为454技术(焦磷酸发光),C为PacBio技术(零模波导孔实时监测),均不符合“边合成边测序”原理。
人类基因组中,“同义突变”的定义是?
A.导致氨基酸改变的单碱基变异
B.不改变氨基酸序列的单碱基变异
C.插入或缺失1-50个碱基的变异
D.拷贝数大于2的基因组片段重复
答案:B
解析:同义突变指突变后密码子编码的氨基酸未改变(如CCT→CCG均编码脯氨酸);A为错义突变,C为Indel,D为CNV(拷贝数变异)。
以下哪个数据库主要用于存储临床意义明确的基因变异?
A.dbSNP
B.ClinVar
C.gnomAD
D.ExAC
答案:B
解析:ClinVar由NCBI维护,专注于收集与疾病相关的变异及其临床意义;A为全物种SNP数据库,C/D为人群变异频率数据库(gnomAD已取代ExAC)。
基因数据质量控制中,“Q30”指标表示?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.比对到参考基因组的读长比例
C.变异位点的杂合子比例
D.样本污染的概率
答案:A
解析:Q30指测序碱基质量值≥30的比例(错误率≤0.1%);B为比对率(如BAM文件的MAPQ),C为杂合度(Heterozygosity),D为污染率(如VerifyBamID结果)。
以下哪个工具常用于基因变异的功能注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.SAMtools
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可注释功能影响、人群频率等;A为变异检测工具(如HaplotypeCaller),C为比对工具,D为序列格式处理工具。
连锁不平衡(LD)的主要影响是?
A.增加基因重组频率
B.导致相邻标记等位基因关联
C.降低单倍型多样性
D.提高全基因组关联研究(GWAS)分辨率
答案:B
解析:LD指染色体上相邻位点的等位基因非随机关联(如A和B常同时出现);A为重组的结果,C/D表述错误(LD会降低GWAS分辨率,因标记可能关联但非因果)。
拷贝数变异(CNV)检测的金标准是?
A.全外显子测序(WES)
B.核型分析(Karyotyping)
C.荧光原位杂交(FISH)
D.比较基因组杂交(aCGH)
答案:D
解析:aCGH(芯片比较基因组杂交)是CNV检测的金标准,可全基因组扫描;A的WES对CNV检测灵敏度低,B分辨率仅5-10Mb,C为局部区域检测。
GWAS(全基因组关联研究)的核心目的是?
A.鉴定疾病相关的结构变异
B.定位与表型关联的遗传标记
C.分析基因表达差异
D.预测药物反应的遗传基础
答案:B
解析:GWAS通过全基因组SNP分型,寻找与疾病/表型显著关联的遗传标记(如p值<5×10??);A为SV研究,C为转录组分析,D为药物基因组学。
生物信息学流程中,“BAM文件”的主要作用是?
A.存储原始测序读长(RawReads)
B.记录比对到参考基因组的序列数据
C.保存变异检测结果(如VCF)
D.展示基因表达量(如FPKM)
答案:B
解析:BAM是二进制格式的比对文件,包含读长在参考基因组上的定位信息;A为FASTQ文件,C为VCF文件,D为表达矩阵文件(如TPM)。
基因数据解读的伦理规范中,“知情同意”的核心要求是?
A.受试者需签署纸质同意书
B.研究者需向受试者充分解释数据用途与风险
C.数据仅用于科学研究,不得共享
D.受试者可随时撤回数据但无权获取结果
答案:B
解析:知情同意的核心是受试者在充分理解数据用途、潜在风险(如隐私泄露)、获益后自愿参与;A为形式要求,C/D不符合伦理指南(数据可在脱敏后共享,受试者有权了解结果)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下属于基因组结构变异(SV)的有?
A.单核苷酸多态性(SNP)
B.插入缺失(Indel,>50bp)
C.倒位(Inversion)
D.易位(Translocation)
答案:BCD
解析:SV指长度>50bp的基因组重排,包括插入、缺失(>50bp)、倒位、易位等;A为单碱基变异(属于小变异)。
基因数据注释需涵盖的关键信息包括?
A.变异在人群中的频率(如gnomAD)
B.变异的功能影响(如SIFT/PolyPh
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