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前胡族中药用植物分类聚类分析的谱系图第29页，共41页，星期日，2025年，2月5日第1页，共41页，星期日，2025年，2月5日绝对值距离:

xik：第i个样本第k个指标

dij：第i个样本与第j个样本之间的距离。

第2页，共41页，星期日，2025年，2月5日两样品的色谱图图Ⅰ图Ⅱ第3页，共41页，星期日，2025年，2月5日各保留时间下的峰高第4页，共41页，星期日，2025年，2月5日用向量表示第5页，共41页，星期日，2025年，2月5日和之间的绝对值距离计算第6页，共41页，星期日，2025年，2月5日例题1试用绝对值距离计算下列样本两两之间的距离第7页，共41页，星期日，2025年，2月5日解：第8页，共41页，星期日，2025年，2月5日

欧氏距离

第9页，共41页，星期日，2025年，2月5日

数据预处理：标准差标准化：

对n个样本，m个指标

第10页，共41页，星期日，2025年，2月5日系统聚类法(Hierarchicalclusteringmethod)先将n个样本各自看成一类，然后规定样本之间的距离和类与类之间的距离。开始时，各样本自成一类，这时类之间的距离与样本之间的距离是相等的，然后选择距离最小的两类合并成新类，并计算该新类与其它类之间的距离，接着再将距离最近的两类合并，这样每次减少一类，直至所有的样本都合并成一类为止。第11页，共41页，星期日，2025年，2月5日一、最短距离法

以G1,G2,……表示类

Dpq表示第p类（Gp）与第q类（Gq）之间的距离

定义：第12页，共41页，星期日，2025年，2月5日例题2：例题1中，p类样本：X1、X2,q类样本：X3、X4，求Dpq？解：第13页，共41页，星期日，2025年，2月5日聚类分析步骤：

1．构成距离矩阵D（0）第14页，共41页，星期日，2025年，2月5日2．选择D（0）中的非对角最小元素，设为Dqp，将Gp和Gq合并成一新类，记为Gr，

Gr={Gp,Gq}第15页，共41页，星期日，2025年，2月5日

3．计算新类和其它类(假定为K类)的距离，从中将距离最短的合并，得新矩阵D(1)

新类和K类的距离为:

Drk=min{Dpk，Dqk}

=min{mindij,mindij}

i∈Gpi∈Gq

j∈Gkj∈Gk第16页，共41页，星期日，2025年，2月5日4.对D（1）重复上一步得D（2），如此下去直到成为一类为止。如果某一步D（m）中最小的元素不止一个，则对应这些最小元素的类可同时合并。

第17页，共41页，星期日，2025年，2月5日?

例3:??6个样本：x1＝1，x2＝2，x3＝5

x4＝7，x5＝9，x6＝10，试分类

1、构成D(0)

第18页，共41页，星期日，2025年，2月5日2、选择D（0）中的最短距离，

G7={G1,G2}G8={G5,G6}

第19页，共41页，星期日，2025年，2月5日?

3、计算新类G7，G8与各类之间的距离D（1）第20页，共41页，星期日，2025年，2月5日?4、??重复2，3

G9={G3,G4,G8}={x3,x4,x5,x6}

最后将G7和G9合并为G10

?

D（2）第21页，共41页，星期日，2025年，2月5日第22页，共41页，星期日，2025年，2月5日分类：阀值法第23页，共41页，星期日，2025年，2月5日例题4：试用绝对值距离以最短距离法，将下列5个样本进行聚类，写出距离矩阵并绘出聚类图。第24页，共41页，星期日，2025年，2月5日构成D(0)

第25页，共41页，星期日，2025年，2月5日计算新类与各类之间的距离第26页，共41页，星期日，2025年，2月5日x1x2x3x4x5第27页，共41页，星期日，2025年，2月5日隔着泡眼测定真假片剂的近红外光谱聚类图真假片剂的马氏距离为2.8第28页，共41页，星期日，2025年，2月5日