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不同马尾松抗松材线虫品种的微生物群落差异研究

目录

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1松材线虫病概况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.2马尾松抗病性研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.1.3植物微生物组与抗病的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2国内外研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.1松材线虫病菌源与环境因素．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.2.2马尾松抗松材线虫机制探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

1.2.3树木内生/根际微生物组研究综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

1.3.1核心研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

1.3.2具体研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

1.4研究技术路线与可行性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.1试验材料来源与样品采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.1.1试验地概况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

2.1.2马尾松样品选取标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.1.3样品采集方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

2.1.4样品保存与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

2.2.1病原菌鉴定与评价．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

2.2.2微生物群落宏基因组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

2.2.3微生物群落数据分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

2.3数据分析方法与指标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

2.3.1Alpha多样性指数计算．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

2.3.2Beta多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

2.3.3差异菌群挖掘．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

2.3.4功能预测分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

2.4基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

2.4.1数据准备与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65

2.4.2差异表达基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66

2.4.3基因功能注释与通路富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．70

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72

3.1样品病原菌检验结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

3.1.1病原分离统计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

3.1.2病原鉴定分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．77

3.2马尾松不同样品微生物群落结构特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79

3.2.1物种组成分析．．．．．．．．．．．．．．．．