2025年大学《生物信息学》专业题库—— 免疫新药发现与生物信息学方法应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——免疫新药发现与生物信息学方法应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在单克隆抗体的生物信息学分析中，对高throughputsequencing（HTS）数据进行质量控制的常用指标不包括：

A.读段长度分布

B.GC含量

C.Q30分数

D.基因组重复区域覆盖率

2.以下哪种生物信息学分析方法最适合用于识别在不同免疫细胞亚群中差异表达的基因？

A.蛋白质质谱峰强度分析

B.基于k-mer的序列聚类

C.差异基因表达分析（如DESeq2）

D.蛋白质互作网络构建

3.V(D)J重排分析在免疫新药发现中的主要应用是：

A.预测基因的转录调控区域

B.评估肿瘤样本的突变负荷

C.识别和量化特异性B细胞或T细胞克隆

D.分析基因家族的进化关系

4.在药物靶点识别过程中，利用蛋白质功能富集分析（如GO富集）的主要目的是：

A.预测蛋白质的三维结构

B.找到与疾病相关的关键信号通路

C.确定蛋白质的精确分子量

D.比较不同基因集的组成差异

5.以下哪种工具或库通常不用于生物信息学中的机器学习模型构建？

A.scikit-learn

B.TensorFlow

C.KEGGMapper

D.PyTorch

6.用于高通量测序数据中SNV检测的软件，其关键输入数据通常来自：

A.蛋白质结构文件

B.基因组参考序列和多个样本的测序读段

C.转录因子结合位点数据

D.免疫细胞表面标记抗体数据

7.在基于结构的药物设计方法中，通常需要使用已知的：

A.药物靶点蛋白质的晶体结构

B.药物分子自身的二维结构图

C.药物作用底物的酶活性位点信息

D.药物在体内的代谢途径数据

8.以下哪种免疫新药类型主要利用了患者自身的免疫细胞进行靶向治疗？

A.单克隆抗体药物

B.免疫检查点抑制剂

C.CAR-T细胞疗法

D.重组人源化抗体

9.生物信息学中，用于衡量基因或特征重要性的方法，如Lasso回归，主要目的是：

A.对数据进行非监督聚类

B.在模型训练中实现特征选择和正则化

C.估计多个样本间的相关性

D.对基因表达量进行标准化

10.对于免疫新药研发中的临床试验数据，生物信息学分析可能侧重于：

A.预测药物在计算机模拟环境中的效果

B.分析患者队列中基因变异与疗效/毒性的关联

C.优化药物分子的化学结构

D.设计临床试验的统计分析方案

二、简答题（每题5分，共25分）

1.简述在进行抗体V(D)J重排序列分析时，需要进行的主要数据处理步骤及其目的。

2.解释什么是生物信息学中的“特征选择”，并列举至少三种在免疫新药发现中可能用于筛选药物靶点的生物信息学特征。

3.描述利用生物信息学方法预测药物靶点分子对接（docking）成功的可能性时，通常需要哪些关键输入信息。

4.简述机器学习模型在预测免疫治疗药物疗效方面的潜在应用场景和可能面临的挑战。

5.阐述在免疫新药研发流程中，数据预处理（DataPreprocessing）环节的重要性及其可能包含的主要任务。

三、计算与分析题（每题15分，共45分）

1.假定你获得了一组来自健康供体和某自身免疫性疾病患者外周血单个核细胞（PBMCs）的基因表达谱数据（已通过预处理，得到每个基因在不同样本中的表达量矩阵）。请设计一个简化的生物信息学分析流程，用于初步筛选可能与该疾病相关的潜在药物靶点基因。你需要说明分析步骤、所使用的核心方法（概念即可，无需具体算法），以及如何解释分析结果以判断一个基因是否具有成为靶点的潜力。

2.某生物信息学研究团队分析了一组接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的肿瘤组织样本，获得了免疫细胞浸润相关的基因表达数据。请设计一个分析方案，利用这些数据尝试识别可能对治疗反应有显著影响的免疫细胞亚群或相关基因。请描述你的分析思路，包括可能使用的方法和需要关注的分析点。

3.假设你正在参与一个抗PD-1单克隆抗体的研发项目，需要利用生物信息学方法进行候选抗体的初步功能预测。请列举至少三个可以通过生物信息学分析来评估抗体潜在疗效或安全性的方面，并简要说明相应的分析方法和预期获得的信息。

试卷答案

一、选择题