我国部分地区牛冠状病毒S基因遗传变异分析.pdfVIP

中国动物传染病学报2025,33(1):188-198ChineseJournalofAnimalInfectiousDiseases

·研究论文·

我国部分地区牛冠状病毒S基因遗传变异分析

1,2,342,32222212,3

张欣怡，高辉，崔进，房琳琳，郑辉，刘爽，魏荣，李晓成，肖啸，董雅琴

（1.云南农业大学，昆明650500；2.中国动物卫生与流行病学中心，青岛266032；3.农业农村部动物生物安全

风险预警及防控重点实验室（南方），青岛266032；4.昭通市职业教育中心，昭通657000）

摘要：为了解我国部分地区牛冠状病毒（BCoV）流行及变异情况，2020—2021年，收集我国9个省份53个临床发病牛群的拭子、

粪便、组织等样品1432份，采用实时荧光RT-PCR方法进行BCoV检测，并选取部分核酸阳性样品进行S基因全长的扩增、测序与

遗传变异分析。53个发病牛群中，BCoV阳性场占54.72%，冬季BCoV感染率（14.87%）最高，犊牛最易感（16.13%）。本研究

共获得17条S基因全长序列与参考序列核苷酸同源性为96.7%~99.7%。系统进化分析表明，BCoV毒株分为欧洲（GⅠ型）和亚-美

（GⅡ型）两大分支，所测毒株均属GⅡ型，且与大多中国参考毒株共同位于GⅡ中相对独立的分支。与中国参考毒株相比，所测

毒株存在60个氨基酸变异位点，所测4个内蒙古毒株存在16个有别于其他测序株的相同突变，推测与中国参考株HLJ/HH-10/2020、

BCoV-GX-NN190313有相同的祖先。该研究为揭示我国BCoV流行情况及流行毒株分子特征提供参考。

关键词：牛冠状病毒；S基因；系统进化分析；氨基酸变异

中图分类号：S852.65文献标志码：A文章编号：1674-6422（2025）01-0188-11

GeneticVariationAnalysisofSGeneofBovineCoronavirusinSomeRegionsofChina

1,2,342,32222

ZHANGXinyi,GAOHui,CUIJin,FANGLinlin,ZHENGHui,LIUShuang,WEIRong,

212,3

LIXiaocheng,XIAOXiao,DONGYaqin

(1.YunnanAgriculturalUniversity,Kunming650500,China;2.ChinaAnimalHealthandEpidemiologyCenter,Qingdao266032,China;

3.KeyLaboratoryofAnimalBiosafetyRiskPreventionandControl(South),Qingdao266032,China;4.ZhaotongVocationalEducation

Center,Zhaotong657000,China)

Abstract:InordertoinvestigatetheprevalenceandgeneticvariationofBovinecor