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第37卷第1期农业研究与应用Vol.37No.1
2024年1月AGRICULTURALRESEARCHANDAPPLICATIONJan.2024
李傅达,黄欣,韦波,等.大泰竹叶绿体全基因组及系统进化分析[J].农业研究与应用,
2024,37(1):7-13
LIFD,HUANGX,WEIB,etal.ChloroplastWholeGenomeandPhylogeneticAnalysisofThyr‐
sostachysoliveri[J].AgriculturalResearchandApplication,2024,37(1):7-13
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试验研究
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大泰竹叶绿体全基因组及系统进化分析
12312221*
李傅达,黄欣,韦波,毛纯,秦波,黄红宝,孙开道,周启华
12
(广西壮族自治区国有七坡林场,广西南宁530225;广西壮族自治区林业科学研究院,广西特色经济林培
3
育与利用重点实验室,广西林业实验室,广西南宁530002;凤山县国有凤山林场,广西河池547699)
摘要:大泰竹(Thyrsostachysoliveri)是一种在东亚地区广泛分布的竹子,具有重要的生
态和经济价值。为获取大泰竹的叶绿体分子生物学特性及明确其系统发育位置,本研究采用
高通量测序技术对其叶绿体基因组进行了测序和组装,获得了完整的大泰竹叶绿体基因组序
列,并对其进行基因组特征解析和系统发育分析。结果表明:(1)大泰竹的叶绿体基因组为
一个典型的双环状结构,全长为139,454bp,LSC区域的长度为82,986bp,SSC区域的长度为
12,878bp,IR区域的长度为21,795bp,全基因组的GC含量为38.90%,共编码了131个基因;
(2)共检测到123个SSR位点,其中单核苷酸SSR最多,为102个,占总数的82.93%;(3)
系统发育分析表明,大泰竹为禾本科竹亚科中的一个明确分支,与牡竹属(Dendrocalamus)
的麻竹(D.latiflorus)和大叶慈(D.farinosus)亲缘关系较近。研究结果明确了大泰竹在竹
类植物中的系统发育位置,同时可为竹类分类和鉴定提供新的分子依据。
关键词:大泰竹;叶绿体基因组;系统发育;SSR
中图分类号:S792.99文献标志码:A
ChloroplastWholeGenomeandPhylogenetic
AnalysisofThyrsostachysoliveri
123122
LIFuda,HUANGXin,WEIBo,MAOChun,QINBo,HUANGHongbao,
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