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2025年大学《生物信息学》专业题库——基因表达谱分析在生物信息学中的应用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分。请将正确选项字母填入括号内。)
1.下列哪一项不是基因表达谱分析的主要目的?
A.比较不同实验条件下基因表达水平的差异
B.识别在特定生物学过程中发挥关键作用的基因
C.直接测定基因的绝对数量
D.探索基因功能与通路富集信息
2.在处理基因芯片原始数据时,探针水平数据转化为基因水平数据的主要步骤是?
A.对数变换
B.探针/基因过滤
C.探针/基因ID映射
D.数据标准化
3.进行差异基因表达分析时,如果不进行多重检验校正,最可能导致的结果是?
A.检测到的显著差异基因数量过多
B.检测到的显著差异基因数量过少
C.FDR值显著降低
D.实际非差异基因被错误判断为差异基因的概率增加
4.以下哪种方法属于非参数检验,常用于比较两组或多组数据的中心趋势?
A.t-test
B.ANOVA
C.Wilcoxonrank-sumtest
D.Kruskal-Wallistest
5.GO富集分析的主要目的是?
A.确定每个基因的具体表达量
B.检测样本之间的差异基因
C.识别一组基因共享的生物学功能、过程或位置
D.对基因进行聚类分类
6.在基因表达热图中,通过聚类将基因或样本聚在一起的主要依据是?
A.基因或样本的表达值大小
B.基因或样本间表达模式的相似性或差异性
C.基因的功能分类
D.样本的实验处理条件
7.RNA-Seq技术相比于传统基因芯片技术,其主要优势之一是?
A.只能检测已知探针的基因
B.通常能提供更灵敏和动态范围更宽的表达量估计
C.无法进行定量分析
D.主要适用于检测基因组中的重复序列
8.在进行时间序列基因表达分析时,特别需要注意去除哪种效应?
A.基线效应
B.循环效应
C.随机噪声
D.系统误差
9.假设我们获得了某种疾病患者的基因表达谱数据,并希望识别与该疾病相关的潜在通路。以下哪种分析方法最直接相关?
A.基于距离的样本聚类
B.差异基因表达分析结合KEGG通路富集分析
C.GO术语富集分析
D.计算样本间的距离矩阵
10.评估基因表达谱数据质量时,以下哪个指标通常不直接考虑?
A.探针/基因的检测率
B.缺失值比例
C.基因表达值的变异系数
D.实验动物的体重
二、填空题(每空1分,共15分。请将答案填入横线处。)
1.基因芯片(Microarray)技术通常通过杂交信号的强度来反映______________。
2.RNA-Seq技术能够提供更全面的基因表达信息,包括______________转录本和______________。
3.在差异基因表达分析中,FoldChange(倍数变化)衡量的是两组间基因表达水平的______________。
4.FDR(FalseDiscoveryRate)指的是在所有被标记为显著差异的基因中,实际是假阳性的基因比例,它属于一种______________校正方法。
5.GO富集分析常用的数据库包括______________和______________。
6.对基因表达数据进行标准化是为了______________不同实验或平台之间数据的不一致性,以便进行有效的比较。
7.层次聚类是一种常用的聚类方法,根据样本或基因表达模式的______________进行逐步合并或分离。
8.时间序列基因表达分析可以用来研究基因表达随______________的变化规律。
9.基因表达谱分析结果的生物学解读需要结合具体的______________背景知识。
10.常用的基因表达谱数据分析软件包R中的Bioconductor项目提供了许多相关的______________。
三、简答题(每题5分,共20分。请简要回答下列问题。)
1.简述从原始基因芯片图像数据到获得基因表达矩阵通常涉及的主要处理步骤。
2.解释什么是标准化在基因表达谱分析中的目的,并列举至少两种常用的标准化方法及其原理简述。
3.描述如何通过GO富集分析结果来推断一个生物学过程的可能变化。
4.在进行基因表
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