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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术基于“边合成边测序”原理?
A.Sanger测序法
B.纳米孔测序(Nanopore)
C.Illumina测序(NGS)
D.PacBio单分子实时测序(SMRT)
答案:C
解析:Illumina测序技术通过桥式PCR扩增DNA簇,结合荧光标记的脱氧核苷酸,在合成新链时通过光学信号读取碱基,属于“边合成边测序”。A选项Sanger测序基于双脱氧核苷酸终止法;B选项纳米孔测序通过检测DNA链通过纳米孔时的电流变化;D选项PacBio利用零模波导孔(ZMW)观察DNA聚合酶合成时的实时信号,均不符合“边合成边测序”原理。
根据ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)标准,临床意义未明的变异应归为哪一级?
A.致病性(Pathogenic)
B.可能致病性(Likelypathogenic)
C.意义未明(VUS)
D.可能良性(Likelybenign)
答案:C
解析:ACMG将变异分为五级:致病性(P)、可能致病性(LP)、意义未明(VUS)、可能良性(LB)、良性(B)。意义未明的变异(VUS)指现有证据不足以支持致病性或良性结论的变异,因此选C。其他选项分别对应明确或倾向的致病性/良性分类。
以下哪个数据库主要用于存储人群中常见遗传变异的频率信息?
A.ClinVar
B.gnomAD
C.dbSNP
D.OMIM
答案:B
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)专注于收集大规模人群的遗传变异频率数据,用于区分罕见变异与常见多态性。A选项ClinVar存储变异的临床意义;C选项dbSNP是广义的变异位点数据库(包括无功能意义的变异);D选项OMIM是人类孟德尔遗传数据库,记录疾病与基因的关联,因此选B。
全外显子测序(WES)的主要目标区域是?
A.所有基因的启动子区
B.编码蛋白质的外显子区域
C.非编码RNA基因区域
D.端粒与着丝粒区域
答案:B
解析:全外显子测序通过捕获探针富集基因组中编码蛋白质的外显子区域(约占基因组的1-2%),用于检测影响蛋白质功能的变异。其他选项中,启动子区(A)、非编码RNA(C)、端粒/着丝粒(D)均非WES的主要目标,因此选B。
在生信分析流程中,“比对(Mapping)”步骤的主要目的是?
A.去除测序数据中的接头污染
B.将测序reads定位到参考基因组
C.识别单核苷酸变异(SNV)
D.评估测序数据的质量
答案:B
解析:比对步骤使用BWA、Bowtie等工具将测序得到的短序列(reads)与参考基因组(如GRCh38)进行匹配,确定其在基因组中的位置。A是“数据过滤”步骤;C是“变异检测”步骤;D是“质量控制(QC)”步骤,因此选B。
以下哪种变异类型不属于结构变异(SV)?
A.拷贝数变异(CNV)
B.插入缺失(Indel)
C.染色体易位(Translocation)
D.倒位(Inversion)
答案:B
解析:结构变异通常指长度≥50bp的基因组变异,包括CNV、易位、倒位等;而插入缺失(Indel)一般指长度50bp的小片段插入或缺失,属于小变异(Smallvariant),因此选B。
评估测序数据质量时,“Q30”指标表示?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.测序深度达到30×的区域比例
C.GC含量偏差≤30%的区域比例
D.比对到参考基因组的reads比例
答案:A
解析:Q30是测序质量的核心指标,定义为质量值≥30的碱基占比(质量值Q=-10log??(错误率),Q30对应错误率1/1000,即0.1%)。其他选项中,B是覆盖度相关指标;C是GC偏差评估;D是比对率,因此选A。
在孟德尔遗传病基因解读中,“常染色体隐性遗传”的典型特征是?
A.患者父母至少一方患病
B.男女患病概率相等
C.连续多代出现患者
D.男性患者远多于女性
答案:B
解析:常染色体隐性遗传病需两个等位基因均致病(纯合或复合杂合),父母通常为无症状携带者,男女患病概率相等(因致病基因位于常染色体)。A是显性遗传特征;C是显性遗传或X连锁显性的特征;D是X连锁隐性遗传特征(如红绿色盲),因此选B。
以下哪种工具主要用于预测错义变异对蛋白质功能的影响?
A.GATK(基因组分析工具包)
B.SIFT(序列同源性预测工具)
C.BWA(比对工具)
D.Samtools(序列格式处理工具)
答案:B
解析:SIFT(SortingIntolerantFromTolerant)通过序列保守性分析预测错义变异是否影响蛋白质功能(耐受/不耐受)。A是变异检测与分析工具;C是比对工具;D是序列格式处理工具,因此选
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