2025年大学《生物信息学》专业题库—— 代谢组学与蛋白质互作网络分析.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——代谢组学与蛋白质互作网络分析

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题

1.代谢组学研究的代谢物种类主要涵盖（）。

A.所有蛋白质

B.所有核酸

C.所有脂质、碳水化合物、核酸和蛋白质小分子

D.仅核糖和脱氧核糖

2.在代谢组学数据预处理中，进行峰对齐的主要目的是（）。

A.降低数据维度

B.消除或减少批次效应和仪器漂移

C.增加数据量

D.精确测定代谢物分子量

3.PCA（主成分分析）在代谢组学中最主要的用途是（）。

A.精确鉴定未知代谢物

B.检测样本间的主要差异模式

C.对数据进行归一化处理

D.构建代谢通路图

4.下列哪种技术通常不用于大规模、高通量的蛋白质互作检测？（）。

A.酵母双杂交系统

B.蛋白质芯片

C.基于质谱的蛋白质组学分析

D.酪氨酸磷酸化抗体免疫印迹

5.蛋白质互作网络中，度值越高的蛋白质节点通常意味着（）。

A.该蛋白质功能越不重要

B.该蛋白质与其他蛋白质的物理接触越多

C.该蛋白质只与少数特定蛋白质互作

D.该蛋白质主要参与代谢过程

6.STRING数据库主要用于（）。

A.基因表达数据分析

B.蛋白质序列比对

C.整合多种来源的蛋白质互作信息并提供可信度评分

D.预测蛋白质结构

7.在蛋白质网络的拓扑学分析中，社区检测的目的是（）。

A.寻找网络中连接最紧密的少数几个节点

B.将网络划分为功能相关的蛋白质模块

C.计算网络中所有可能的最短路径

D.评估网络的连通性

8.将代谢组学数据与蛋白质互作网络数据整合分析的主要意义在于（）。

A.仅用于验证代谢组学实验结果

B.探索代谢变化如何通过蛋白质网络传导和影响生物学功能

C.提高蛋白质互作网络的覆盖度

D.简化数据分析流程

二、填空题

1.代谢组学根据研究深度和广度可分为______和______两大类。

2.常用的代谢物数据库包括HMDB和______。

3.PLS-DA模型中，正交成分（赤池信息量最优）主要用于______。

4.蛋白质互作研究的核心目标是揭示蛋白质之间的______关系。

5.蛋白质互作网络分析中，常用的拓扑参数包括度、介数中心性和______。

6.GO（GeneOntology）数据库主要用于对基因和蛋白质进行______、______和______的注释。

三、简答题

1.简述代谢组学实验中LC-MS和GC-MS技术的原理区别及其主要适用范围。

2.简述在进行代谢组学数据分析时，选择和解释OPLS-DA模型结果的要点。

3.简述蛋白质互作数据来源的主要类型及其特点。

4.简述蛋白质互作网络中，聚类系数（ClusteringCoefficient）这一拓扑参数的生物学含义。

四、计算与分析题

1.假设你获得了一组比较两组样本（组A和组B）的代谢组学数据，经过PCA分析，发现第一主成分（PC1）解释了总变异的55%，PC1的得分图显示组A和组B在PC1轴上明显分离。请简述如何进一步分析PC1上的这种差异，并解释其潜在的生物学意义。

2.你获得了一个包含100个蛋白质节点和150个互作边的蛋白质互作网络。网络中有一个蛋白质节点（ProteinX）的度值为50。请解释度值为50的生物学意义，并说明如果要将此网络进行社区检测，你认为哪些方法或指标可能有助于评估社区划分的质量。

五、综合应用题

1.假设研究者在研究某种疾病时，分别获得了该疾病患者和健康对照的代谢组学数据集和蛋白质互作网络数据集。请设计一个初步的整合分析策略，说明你将如何利用这些数据来探索该疾病可能的代谢改变及其相关的蛋白质网络变化，并阐述该策略的潜在生物学启示。

试卷答案

一、选择题

1.C

2.B

3.B

4.D

5.B

6.C

7.B

8.B

二、填空题

1.全局代谢组学，靶向代谢组学

2.METLIN

3.消除样本间由非差异因素引起的系统性变化

4.相互作用（或：结合）

5.聚类系数

6.功能，通路，位置

三、简答题

1.解析思路：首先要答出两种技术的核心分离机制（色谱分离方式不同），然后分别说明原理和适用范围。LC-MS适用于极性、热不稳定、挥发性差、分子量较大的化合物