2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学在进化生物学研究中的作用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在进化生物学研究中的作用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在进化生物学研究中，系统发育树的拓扑结构主要反映了什么？

A.物种之间的地理分布关系

B.物种之间的形态相似程度

C.物种之间的亲缘关系和进化历史

D.物种数量随时间的变化

2.下列哪种生物信息学工具主要用于对DNA或蛋白质序列进行全局比对？

A.系统发育树构建软件（如RAxML）

B.多序列比对软件（如ClustalOmega）

C.分子时钟分析软件（如BEAST）

D.基因表达分析软件（如RSEM）

3.“分子时钟”假说在进化生物学中的主要作用是什么？

A.解释物种颜色变化的机制

B.推测物种迁徙的路线

C.假设基因突变以相对恒定的速率发生

D.描述物种体型进化的趋势

4.在进行系统发育树构建时，选择合适的进化模型对于获得准确结果至关重要。以下哪种模型通常更适合用于分析蛋白质序列？

A.Jukes-Cantor模型

B.Kimura2-parameter模型

C.Tamura-Nei模型

D.WAG模型（WAG）

5.贝叶斯系统发育分析相较于传统的分子进化模型选择方法（如最大似然法），其主要优势之一在于什么？

A.通常能更快地完成计算

B.可以同时估计树的拓扑结构和树的参数（如速率）

C.对小规模数据集效果更好

D.不需要指定进化模型

6.当研究者需要处理存在杂交或古老重组的历史数据时，系统发育树可能不再适用，此时可能需要采用什么工具？

A.遗传距离矩阵计算

B.系统发育网络（PhylogeneticNetwork）

C.分子时钟检验

D.序列多重比对

7.从NCBIGenBank数据库中检索特定物种的核糖体RNA（rRNA）基因序列，最常用的检索工具是什么？

A.BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)

B.ClustalW

C.MrBayes

D.BEAST

8.在构建系统发育树后，评估树分支支持度常用的方法有哪些？（多选）

A.自举法（Bootstrap）

B.后验概率（PosteriorProbability）

C.熵值分析

D.序列相似度计算

9.以下哪项技术通常不直接用于构建物种间的系统发育关系？

A.基因序列比对与系统发育树构建

B.表型数据聚类分析

C.脱氧核糖核酸（DNA）指纹图谱比较

D.线粒体DNA序列分析

10.大规模基因组测序技术的普及对进化生物学研究产生了哪些影响？（多选）

A.使得研究关注点从少数模式物种扩展到更多物种

B.提高了系统发育重建的分辨率和准确性

C.对计算资源和数据分析方法提出了更高要求

D.促进了宏进化（Macroevolution）和群体遗传学（PopulationGenetics）的整合研究

二、填空题（每空1分，共15分）

1.系统发育学是研究生物________关系的科学，其核心工具是________。

2.将多个序列排列成具有特定对齐格式的过程称为________。

3.衡量两个序列之间相似程度的常用指标是________。

4.基于分子进化速率相对恒定的假设，可以利用序列差异来估计物种之间的________。

5.在系统发育分析中，选择合适的________模型对于准确反映序列进化历史至关重要。

6.基于________准则构建的树通常被认为是“最简约”的。

7.除了构建系统发育树，贝叶斯方法还可以用于估计________和________。

8.用于从生物数据库中检索序列的强大工具________是生物信息学的基础技术之一。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述系统发育树的基本拓扑结构包含哪些主要分支类型。

2.比较距离法和模型基于法（如最大似然法、贝叶斯法）在系统发育树构建中的主要区别。

3.简述利用生物信息学方法研究一个新物种的系统发育地位的典型流程。

4.简述什么是分子时钟假说，并列举至少两种检验分子时钟的方法。

四、论述题（每题10分，共20分）

1.论述高通量测序技术（如二