2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学在植物学研究中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在植物学研究中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每小题2分，共20分。请将正确选项的代表字母填写在答题纸上。）

1.在植物基因组研究中，用于评估不同物种基因组间相似性的主要方法是？

A.基因表达谱分析

B.蛋白质结构域预测

C.系统发育树构建

D.DNA序列多态性分析

2.对于大规模RNA-Seq数据，进行差异表达基因分析时，通常需要考虑哪些关键因素？（请选择所有适用项）

A.底噪水平

B.度量基因表达变化的统计方法选择

C.重复样本的数量和设计

D.RNA提取质量

3.在植物抗病基因研究中，利用生物信息学进行全基因组关联分析（GWAS）时，核心的步骤通常包括哪些？（请选择所有适用项）

A.确定研究群体的表型数据

B.获取高质量的全基因组序列数据

C.进行群体遗传结构分析以控制混杂

D.使用统计模型（如混合线性模型）检测与表型显著关联的遗传标记

4.已知一个植物基因的cDNA序列，欲获得其编码蛋白质的二级结构预测，以下哪种生物信息学工具或资源是常用的？

A.BLAST

B.NCBIGenBank

C.SMART或CDD数据库

D.InterProScan

5.在代谢组学研究中，用于对未知代谢物进行鉴定的重要生物信息学资源是？

A.基因表达数据库（如GEO）

B.蛋白质序列数据库（如UniProt）

C.代谢物精确质量数据库（如MassBank）

D.系统发育树构建软件包

6.对于长片段DNA序列的组装，尤其是在非模型植物中，以下哪种策略或算法通常更为有效？

A.基于短读长序列的组装（如SPAdes）

B.基于长读长序列（如PacBio或OxfordNanopore）的直接组装

C.基于转座子捕获的组装策略

D.基于RNA-Seq数据的denovo组装

7.在构建植物基因调控网络时，除了基因表达数据外，还可能利用哪些类型的数据来增强网络构建的可靠性？（请选择所有适用项）

A.蛋白质相互作用数据

B.染色质相互作用数据（如ChIP-seq）

C.非编码RNA靶点预测数据

D.转录因子结合位点信息

8.以下哪项技术或方法主要利用生物信息学手段来研究植物表观遗传学特征？

A.基因芯片（Microarray）

B.亚硫酸氢氢根测序（BS-seq）

C.RNA-Seq测序

D.基于重测序的群体结构分析

9.在进行植物比较基因组学研究时，研究者通常关注哪些方面的异同？（请选择所有适用项）

A.基因组大小和重复序列比例

B.基因家族的扩张与收缩

C.染色体结构变异（如易位、倒位）

D.特定功能基因（如抗病基因）的分布和演化

10.利用生物信息学预测植物基因的功能时，以下哪种方法是常见的“反向遗传学”策略？

A.基于同源基因的序列和结构预测

B.基于基因表达谱的GO富集分析

C.基于蛋白质互作网络的通路分析

D.通过CRISPR/Cas9技术进行功能验证（计算预测）

二、简答题（每小题5分，共25分。请将答案填写在答题纸上。）

1.简述利用生物信息学进行植物转录组差异表达分析的主要流程。

2.解释什么是植物基因组注释，并简述其主要包含的内容。

3.描述生物信息学在研究植物抗逆性机制方面可以提供哪些方面的帮助。

4.简述代谢组学数据中常用的多元统计分析方法及其目的。

5.说明在植物研究中，整合多组学数据进行分析相较于单一组学分析有哪些优势。

三、分析题（每小题10分，共30分。请将答案填写在答题纸上。）

1.假设你正在参与一项研究，目标是鉴定一个与小麦抗旱性相关的候选基因。你已获得一个抗旱小麦品种和一个敏感小麦品种的全基因组重测序数据。请简述你会运用哪些生物信息学方法来寻找并初步验证这个候选基因。

2.某研究团队发表了一篇论文，报道了利用RNA-Seq数据构建的一个主要调控水稻叶绿素合成过程的基因调控网络。请分析该研究中，生物信息学分析可能涉及的关键步骤以及可能存在的局限性。

3.设想你需要为一个非模型植物物种设计一个初步的基因组测序和注释项目。请列出在项目设计阶段，你需要考虑的生物信息学相关的关键问题和技术选择。

四、论述题（15分。请将答案填写在答题