2025年大学《生物信息学》专业题库—— 进化生物信息学的研究进展.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——进化生物信息学的研究进展

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.下列哪一项不属于系统发育树的构建方法？

A.邻接法

B.贝叶斯法

C.最大似然法

D.主成分分析

2.在分子进化模型中，Jukes-Cantor模型假设哪种情况？

A.转换和颠换的速率相等

B.转换和颠换的速率不相等

C.遗传密码是简并的

D.核苷酸的替换是随机的

3.下列哪种方法通常用于检测正选择？

A.系统发育树构建

B.分子进化速率分析

C.选择压力分析

D.线粒体DNA测序

4.多重序列比对的主要目的是什么？

A.构建系统发育树

B.检测选择压力

C.确定序列之间的相似性

D.进行基因表达分析

5.基于系统发育树的生物多样性研究属于进化生物信息学的哪个分支？

A.分子进化模型

B.系统发育分析

C.选择压力分析

D.宏进化研究

6.下列哪种软件通常用于贝叶斯系统发育树构建？

A.MEGA

B.RAxML

C.MrBayes

D.ClustalW

7.在进化生物信息学中，bootstrap通常指的是什么？

A.数据抽样

B.模型选择

C.系统发育树构建

D.选择压力分析

8.基因家族树的构建通常需要考虑哪些因素？

A.基因序列

B.基因结构

C.基因功能

D.以上所有

9.进化路径分析通常用于研究什么问题？

A.基因功能的演化

B.蛋白质结构的演化

C.物种间的进化关系

D.以上所有

10.下列哪种技术通常不用于进化生物信息学数据分析？

A.生物信息学数据库检索

B.序列比对

C.基因组测序

D.系统发育树构建

二、填空题（每空1分，共10分）

1.系统发育树反映了物种之间的__________关系。

2.分子钟假说认为不同物种的分子进化速率__________。

3.选择压力是指影响基因频率变化的__________。

4.系统发育树构建常用的距离度量方法包括__________和__________。

5.PAML软件主要用于__________分析。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述系统发育树构建的两种主要方法及其原理。

2.简述正选择和负选择的区别。

3.简述多重序列比对的基本步骤。

4.简述进化生物信息学在病原体进化研究中的应用。

四、论述题（10分）

论述机器学习技术在进化生物信息学中的应用前景。

五、分析题（20分）

假设你获得了一组来自不同物种的蛋白质序列，请简述你将如何运用进化生物信息学方法分析这些数据，以探究这些物种之间的进化关系以及蛋白质的功能演化。请说明你将使用哪些工具和方法，并简述分析步骤。

试卷答案

一、选择题

1.D

2.A

3.C

4.C

5.B

6.C

7.A

8.D

9.D

10.C

二、填空题

1.进化

2.相等

3.遗传因素

4.系统发育距离，时间距离

5.选择压力

三、简答题

1.系统发育树构建的两种主要方法及其原理：

*邻接法：原理是基于距离矩阵，将进化距离最近的两个节点合并，不断重复此过程，直到所有节点都连接在一起形成一个树状结构。

*贝叶斯法：原理是基于贝叶斯定理，利用先验概率和似然函数计算后验概率，通过马尔科夫链蒙特卡洛模拟等方法估计系统发育树的概率分布。

2.正选择和负选择的区别：

*正选择：指的是那些能够提高基因频率的选择压力，通常与有利突变相关。

*负选择：指的是那些能够降低基因频率的选择压力，通常与有害突变相关。

3.多重序列比对的基本步骤：

*序列选择：选择要进行比对的序列。

*初始比对：使用简单的算法（如ClustalW）进行初始比对。

*迭代优化：使用更复杂的算法（如MUSCLE）进行迭代优化，直到达到收敛。

4.进化生物信息学在病原体进化研究中的应用：

*构建病原体系统发育树：了解病原体的进化关系和传播历史。

*检测病原体的变异：识别新的毒株和耐药性基因。

*预测病原体的传播趋势：为疫情防控提供科学依据。

四、论述题

机