2025年单细胞多组学（scRNA-seq+scATAC-seq）整合分析考核试卷.docVIP

2025年单细胞多组学（scRNA-seq+scATAC-seq）整合分析考核试卷

一、单项选择题（每题1分，共30题）

1.scRNA-seq数据分析中，常用的降维方法不包括：

A.PCA

B.t-SNE

C.UMAP

D.k-means

2.scATAC-seq技术主要检测：

A.RNA转录本

B.蛋白质表达

C.DNA甲基化

D.染色质可及性

3.在整合分析中，scRNA-seq和scATAC-seq数据通常通过什么方法对齐？

A.k-mer匹配

B.共同基因集

C.句法分析

D.语义网络

4.scRNA-seq数据中，高表达基因通常具有：

A.低可及性

B.高可及性

C.低变异度

D.无明显特征

5.scATAC-seq数据中，染色质可及性高的区域通常对应：

A.碱基修饰区

B.基因启动子区

C.转录终止区

D.内含子区域

6.整合分析中，常用的距离度量方法不包括：

A.Euclideandistance

B.Manhattandistance

C.Cosinesimilarity

D.Mutualinformation

7.在整合分析中，如何处理scRNA-seq和scATAC-seq数据的批次效应？

A.通过PCA降维

B.通过双变量散点图校正

C.通过共表达网络分析

D.通过批次效应校正工具

8.scRNA-seq数据中，稀疏性是指：

A.基因表达量低

B.细胞数量少

C.数据噪声大

D.重复实验多

9.scATAC-seq数据中，峰调用不准确的原因可能包括：

A.测序深度不足

B.预处理参数设置不当

C.细胞异质性高

D.上述所有原因

10.整合分析中，如何识别细胞类型？

A.通过基因表达模式

B.通过染色质可及性

C.通过差异基因分析

D.通过上述所有方法

11.scRNA-seq数据中，常用的聚类方法不包括：

A.K-means

B.hierarchicalclustering

C.DBSCAN

D.Gaussianmixturemodel

12.scATAC-seq数据中，峰调用工具常用的参数不包括：

A.PCR循环数

B.读取长度

C.峰检测阈值

D.碱基修饰识别

13.整合分析中，如何评估两个数据集的相似性？

A.通过相关性分析

B.通过一致性检验

C.通过互信息计算

D.通过上述所有方法

14.scRNA-seq数据中，高变异基因通常对应：

A.细胞类型特异性

B.细胞间异质性

C.基因功能多样性

D.上述所有原因

15.scATAC-seq数据中，染色质可及性区域通常对应：

A.基因表达区域

B.非编码RNA区域

C.转录调控区域

D.上述所有区域

16.整合分析中，如何处理数据中的缺失值？

A.通过插值法

B.通过多重插补

C.通过删除缺失值

D.通过上述所有方法

17.scRNA-seq数据中，常用的差异基因分析方法不包括：

A.t-test

B.Wilcoxontest

C.DESeq2

D.Fishersexacttest

18.scATAC-seq数据中，常用的峰调用工具不包括：

A.MACS2

B.peakcaller

C.ATAC-seqpeakcaller

D.DESeq2

19.整合分析中，如何识别细胞状态转换？

A.通过轨迹分析

B.通过差异表达分析

C.通过共表达网络

D.通过上述所有方法

20.scRNA-seq数据中，常用的主题模型不包括：

A.NMF

B.LDA

C.PCA

D.t-SNE

21.scATAC-seq数据中，常用的可及性图谱构建方法不包括：

A.ATAC-seqaccessibilitymap

B.ChromHMM

C.MACS2

D.ATAC-seqpeakcaller

22.整合分析中，如何评估整合效果？

A.通过R2值

B.通过MDS分析

C.通过细胞类型重合度

D.通过上述所有方法

23.scRNA-seq数据中，常用的富集分析方法不包括：

A.GOenrichment

B.KEGGpathwayanalysis

C.GSEA

D.t-test

24.scATAC-seq数据中，常用的染色质状态分类方法不包括：

A.ChromHMM

B.ATAC-seqaccessibilitymap

C.MACS2

D.DESeq2

25.整合分析中，如何处理数据中的批次效应？

A.通过双变量散点图校正

B.通过批次效应校正工具

C.通过PCA降维

D.通过上述所有方法

26.scRNA-seq数据中，常用的细胞周期检测方法不包括：

A.CellCycleKit

B.scycle

C.PCA

D.t-SNE

27.scATAC-seq数据中，常用的染色质可及性预测方法不包括：

A.ATAC-seqaccessibilityprediction

B.ChromH