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原核生物的转录与调控;转录(transcription)——

生物体以DNA为模板按5’?3’方向合成RNA的过程;参与转录的物质：;A.原核生物的转录;一、转录概述;起始点(startpoint)：合成第一种RNA碱基的位置，用“+1〞表达。

启动子(promoter)：位于转录起始点前，和RNA聚合酶结合的一段DNA序列。

终止子(terminator)：使RNA聚合酶终止转录的一段DNA序列。

转录单位(transcriptionunit)：从启动子到终止子间的一段DNA序列。;上游序列：基因中起始点前面的序列，用“-〞表达

下游序列：在起始点背面的序列，用“+〞表达

初级转录本：刚转录完毕的RNA产物

转录泡：RNA聚合酶与启动子结合后形成的DNA解旋区。转录泡可和RNA聚合酶一起沿DNA链挪动，RNA合成在转录泡内进展。;转录泡的构造

当RNA聚合酶沿DNA模板挪动时，它翻开泡前的DNA双螺旋〔在解链点翻开〕，并在复链点使DNA复原。

转录泡的长度随增长反响阶段而异，在12-20bp之间(17bp)，但其中的RNA-DNA杂合双螺旋区域比这个长度要短(12bp)。;二、转录的主线过程

1.识别启动子

RNA聚合酶识别启动子，并在启动子处结合形成一种“转录泡〞，转录泡内的DNA双链解开，为RNA合成提供模板。;2.转录起始

a.转录起始无需引物。

b.流产起始：转录起始后直到形成9个核苷酸短链的过程是通过启动子阶段，此时RNA聚合酶一直处在启动子区域，新生RNA链与DNA模板链的结合不够结实，很轻易从DNA链上掉下来并导致转录重新开场，这一过程称为流产起始。

c.启动子清除：一旦RNA聚合酶成功地合成9个以上核苷酸并分启动动子区域，转录就进入正常的延伸阶段，这一过程称为启动子清除。

d.通过启动子的时间代表一种启动子的强弱，时间越短阐明该基因转录起始的频率越高。;3.链的延伸

RNA聚合酶沿DNA模板链挪动并使新生RNA链不停伸长的过程。大肠杆菌RNA聚合酶的活性一般为每秒50-90个核苷酸。酶挪动时部分解旋DNA；酶通过之后，DNA又重新形成双螺旋。;4.链的终止和释放;三、大肠杆菌RNA聚合酶

1.RNA聚合酶的功能

a.RNA合成

b.合成起始和终止位点的识别

c.确定与DNA结合位点的结合与脱离的时间等;关键酶coreenzyme;2)?因子的功能：

使RNA聚合酶特异性地???启动子结合。

大肠杆菌中最常见的?因子是?70

关键酶不能辨别DNA的启动子和其他序列，它与DNA非选择性结合形成松散型复合体。?因子是通过将关键酶对非特异序列的亲和力减少104倍，同步增长其对启动子的亲和力来协助启动子识别的。

RNA链延伸至8-9nt时，?因子会从RNA聚合酶中释放出来，它可以再与其他关键酶结合重新起始转录。;3.RNA聚合酶在细胞内的分布形式

1)很少有游离的关键酶和全酶

2)细胞内?因子数量只有关键酶的30%，因此在任何时刻只有1/3的聚合酶能以全酶的形式存在。;四、转录的机制

1.启动子识别和转录起始

1)在RNA聚合酶开场链延长前，它与DNA的互相作用经历了4个阶段：

a.RNA聚合酶与处在碱基配对状态的启动子序列结合形成闭合复合物。

b.DNA的初始解旋导致DNA与聚合酶形成开放复合物，这一过程称为严密结合。

c.进展一再流产起始

d.起始成功后，聚合酶释放?因子，形成聚合酶-DNA-新生RNA的三聚复合物，RNA链开场延伸。;RNApol是怎样发现对的的起点而启动基因转录的呢？;1)启动子的识别取决于共有序列

保守性序列：每个启动子都包括一种能被RNA聚合酶识别的特性DNA序列。

共有序列：是根据保守性序列总结出的一种理想序列，它的每一种位置代表了诸多实际序列中最常常发现的碱基。经典的启动子有3个共有序列：

-35序列、-10序列和起始点序列;细菌启动子有４个保守性特性：

转录起始点：开场碱基90%是嘌呤，G比A更常见。

-10序列：起始点上游一种6bp区，这个六聚体的中心靠近起始点上游的第10碱基对，它的共有序列是TATAAT。-10序列是RNA聚合酶的结实结合位点，是聚合酶启动DNA解旋的序列。因此，-10序列可通过影响开放复合物的形成速度而控制转录。

-35序列：也是一种六聚体，其中心位于-35碱基对处，它的共有序列是TTGACA，是RNA聚合酶的识别位点。

-35和-10序列之间的间隔非常重要，在90%的启动子中变动在16和18个碱基之间，两序列间为17bp时转录效率最高。;启动子的突变影响它所控制的基因的转录程度而不变化转录产物：

下降突变：TATAATAATAAT