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2025年GWAS数据质控与主成分分析（PCA）考核试卷
一、单项选择题（每题1分，共30题）
1.在GWAS数据质控中，以下哪项不是常见的质量控制步骤？
A.剔除离群值
B.哈迪-温伯格平衡检验
C.个体重复检测
D.基因组变异注释
2.哈迪-温伯格平衡检验主要用于检测：
A.位点的Hardy-Weinberg平衡状态
B.基因型频率的分布
C.等位基因频率的分布
D.基因座间的连锁不平衡
3.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测个体重复？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
4.PCA分析中，主成分的排序依据是：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
5.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量连锁不平衡？
A.D
B.r2
C.LDblock
D.基因型频率
6.在GWAS数据质控中，以下哪项不是常见的变异过滤标准？
A.MAF（等位基因频率）
B.HWEp值
C.基因型缺失率
D.基因座数量
7.PCA分析中，第一主成分解释的方差通常占：
A.10-20%
B.20-30%
C.30-40%
D.40-50%
8.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测近亲关系？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
9.PCA分析中，主成分的命名通常基于：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
10.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量基因型数据质量？
A.HWEp值
B.MAF
C.基因型缺失率
D.连锁不平衡
11.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测样本质量？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
12.PCA分析中，主成分的排序依据是：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
13.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量连锁不平衡？
A.D
B.r2
C.LDblock
D.基因型频率
14.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测个体重复？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
15.PCA分析中，第一主成分解释的方差通常占：
A.10-20%
B.20-30%
C.30-40%
D.40-50%
16.在GWAS数据质控中，以下哪种变异过滤标准通常用于筛选SNP？
A.MAF
B.HWEp值
C.基因型缺失率
D.基因座数量
17.PCA分析中，主成分的命名通常基于：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
18.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量基因型数据质量？
A.HWEp值
B.MAF
C.基因型缺失率
D.连锁不平衡
19.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测样本质量？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
20.PCA分析中，主成分的排序依据是：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
21.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量连锁不平衡？
A.D
B.r2
C.LDblock
D.基因型频率
22.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测个体重复？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
23.PCA分析中，第一主成分解释的方差通常占：
A.10-20%
B.20-30%
C.30-40%
D.40-50%
24.在GWAS数据质控中，以下哪种变异过滤标准通常用于筛选SNP？
A.MAF
B.HWEp值
C.基因型缺失率
D.基因座数量
25.PCA分析中，主成分的命名通常基于：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
26.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量基因型数据质量？
A.HWEp值
B.MAF
C.基因型缺失率
D.连锁不平衡
27.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测样本质量？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
28.PCA分析中，主成分的排序依据是：
A.方差贡献率
B.基因型频率
C.等位基因频率
D.基因座位置
29.在GWAS数据中，以下哪种指标可以用来衡量连锁不平衡？
A.D
B.r2
C.LDblock
D.基因型频率
30.在GWAS数据质控中，以下哪种方法可以用于检测个体重复？
A.PCA分析
B.基因型检测
C.哈迪-温伯格平衡检验
D.连锁不平衡分析
二、多项选择题（每题2分，共20题）
1.在GWAS数据质控中，常见的质量控制步骤包括：
A.剔除离群
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