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微生物群落代谢工程在生物制造中的应用研究1

微生物群落代谢工程在生物制造中的应用研究

摘要

微生物群落代谢工程作为合成生物学与系统生物学交叉领域的前沿技术，正在深

刻改变传统生物制造的范式。本报告系统研究了微生物群落代谢工程在生物制造中的

应用现状、理论基础、技术路线及实施方案。研究表明，通过理性设计与优化微生物群

落结构，可实现复杂生物合成途径的高效协同表达，显著提升目标产物的产率与生产效

率。报告分析了当前生物制造产业面临的挑战，包括单一菌株工程局限性、代谢负担过

重等问题，并提出基于群落代谢工程的系统性解决方案。技术层面，报告详细阐述了群

落设计原则、代谢通路重构策略、动态调控机制等关键技术，并结合案例数据展示了其

在医药、化工、能源等领域的应用潜力。预计通过本研究的实施，可将目标产物产率提

升30%50%，生产成本降低20%30%，为我国生物制造产业转型升级提供重要技术支撑。

引言与背景

生物制造产业发展现状

生物制造作为绿色生物经济的核心组成部分，正经历从传统发酵向精准生物合成的

深刻变革。根据国家统计局数据，2022年我国生物制造产业规模已突破3万亿元，年均

增长率保持在15%以上。这一增长态势主要得益于合成生物学技术的突破性进展，使

得微生物细胞工厂能够高效生产高附加值化合物。然而，传统基于单一菌株的代谢工程

策略在应对复杂生物合成网络时逐渐显现局限性，包括代谢负担过重、中间产物积累抑

制、途径优化空间有限等问题。这些问题严重制约了生物制造产业的进一步发展，亟需

新的技术范式突破瓶颈。

微生物群落代谢工程兴起

微生物群落代谢工程应运而生，成为解决上述挑战的重要途径。不同于传统的单菌

工程策略，群落代谢工程通过构建多菌种协同体系，将复杂的生物合成途径分解到不同

微生物中执行，实现代谢负荷的合理分配与功能模块化。美国国家科学院2019年报告

指出，群落代谢工程可使目标产物产率提升25倍，同时降低30%以上的能耗。这一技

术优势使其迅速成为国际生物技术竞争的新焦点，欧美等发达国家已将其列为生物经

济战略重点发展方向。

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研究意义与必要性

我国”十四五”生物经济发展规划明确提出要”突破合成生物学等前沿技术”，而微生

物群落代谢工程正是合成生物学领域最具应用潜力的方向之一。开展相关研究不仅符

合国家战略需求，更能解决生物制造产业面临的关键技术瓶颈。通过系统研究群落代谢

工程原理与技术，可建立自主可控的技术体系，打破国外专利壁垒，提升我国生物制造

产业的核心竞争力。同时，这一技术还可推动医药、化工、能源等传统产业向绿色低碳

转型，助力实现”双碳”目标。

研究概述

研究目标定位

本研究旨在建立系统化的微生物群落代谢工程理论与技术体系，解决生物制造中

的关键科学与技术问题。具体目标包括：1）揭示微生物群落互作机制与代谢流分配规

律；2）开发群落理性设计与优化算法；3）构建动态调控元件库与标准化操作流程；4）

在35个典型生物制造案例中验证技术有效性。通过这些目标的实现，将为生物制造产

业提供新一代技术解决方案。

研究内容框架

研究内容围绕”理论技术应用”三个维度展开。理论层面重点研究群落代谢网络建

模、互作机制解析、稳定性维持等基础问题；技术层面聚焦群落设计工具开发、调控元

件构建、高通量筛选平台建立等关键技术；应用层面选择医药中间体、生物基材料、生

物燃料等代表性产品进行技术验证。这种”三位一体”的研究框架确保了成果的系统性与

实用性。

创新点与突破方向

本研究的主要创新点包括：1）提出基于代谢负荷均衡的群落设计新原理；2）开发

多尺度耦合的群落优化算法；3）构建可编程的动态调控系统；4）建立群落代谢工程的

标准化流程。这些创新将填补国内相关领域空白，形成具有自主知识产权的技术体系。

特别是在群落动态调控方面，研究将突破现有静态设计的局限，实现群落行为的智能控

制。

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政策与行业环境分析

国家战略政策支持

我国高度重视生物制造产业发展，先后出台多项支持政策。《“十四五”生物经济发

展规划》明确将