系统发育学说.pptVIP

也可人为地给无序特征编排成一定的次序，然后按此次序给以编码。例如将歪型尾、正型尾、凹型尾、无尾等分别表示为1、2、3、4等。此外，在选用特征时，特征所涉及的面愈宽，愈全面愈好。另外,由于这些数据的量度标准不同，其意义与单位也不同.因此不论是绝对值大小或变化幅度等方面差距很大。运算中常造成绝对值大的数据掩盖绝对值小的数据，严重干扰运算结果的现象。例:天牛(单位:mm)体长触角毛上颚后腔毛阳茎A601730.02B551.5540.07在运算中，体长这组特征值将起主宰作用，而阳茎侧叶长这一分类上有重要意义的特征，由于数值相对小，反而变得微不足道因此，必须将原始数据按一定原则加以变换，才能克服这个缺点。常用的原始数据变换方法又称标准化处理方法为:(特征值-平均值)/标准差6、数据的运算数据经过标准化处理后。即可进入运算阶段。一般情况下,运算均由计算机按一定的运算公式及程序来完成首先，将已编码的各项数据编成表格或矩阵,然后逐次求算每两个OTU之间的总体相似程度。相似程度的求算方法1）二态特征数据（1)用相似值或相似系数求算公式为：（2)联合系数法2）非二态特征数据（1)距离系数（2)相似性相关系数7、簇群分析将两个一组的OTU相似性程度分别求得后，制成矩阵，即可进行分类运算(或称簇群分析clusteranalysis)。以求得全部待分的OTU之间的相互关系，编成相似程度树形图簇群分析常用的方法:单连锁法(最小距离法)全连锁法(最大距离法)平均连锁法算术平均法不加权算术平均法加权算术平均法(群平均法)数值分类图8、反对意见1)一般认为特征在进化上的意义并不均等。因此在分析系统发育关系时应加以加权。2)由不加权的特征所得的总体相似性所表示的表型单元(OUT)不能代表分类单元(taxon)。因此不能用于系统发育的探讨。即不能识别趋同，不能说明进化事件，是纯粹的机械归类。同一组原始数据，用不同的计算公式或计算程序计算,会得出不同的结果。说明结果很不稳定，可靠性差。MethodC:codingwithshapeandcolorattributestreatedastwoindependentbinarycharactersandanadditionalcodeforpresenceandabsenceofthefeatures;1Featureabsent（0）;Featurepresent（1）2round（0）;square（1）3black（0）;white（1）MethodD:1Featureabsent（0）;Featurepresent（1）2roundabsent（0）;roundpresent（1）3squareabsent（0）;squarepresent（1）4blackabsent（0）;blackpresent（1）;5whiteabsent（0）;whitepresent（1）6、编制矩陈特征编码后要对特征的编值列出矩陈．距陈数值可以输入计算机，用适当的软件（PAUP，Hennig86等）进行运算，构建支序图支序图所反映的主要是分支事件发生的相对顺序。当赋以进化意义时，该图就成为系统树。在支序图中，一个分支点代表新特征的形成或新分类单元的产生。代表了一个假想的祖种。支序分析就是要确立各分支点在支序图中的相对位置或相对顺序（即孰先孰后），而分支的长度是任意的，不具任何意义。由上述可见，支序图不仅表示了分类单元之间的进化关系，同时也是各个性状的演变关系图。7、分类系统的建立文序图构筑后，最后要建立分类系统先要分清3种类群单系群:共同祖先+全部后代,指标为共同衍征复系群:共同祖先+部分后代,指标为共同祖征并系群:不包括最近的祖先,趋同特征8、总结:支序分析的步骤1）首先应对该类群作全面分析，初步确定其为一单系群。并了解与邻近群的关系，或在更高一级阶元