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基于机器学习的分子结构剖析:精准预测潜在环境内分泌干扰物
一、引言
1.1研究背景与意义
环境内分泌干扰物(EnvironmentalEndocrineDisruptors,EEDs),又被称作内分泌干扰化合物(EndocrineDisruptingChemicals,EDCs)或环境激素(EnvironmentalHormones),是一类能干扰生物体内天然激素合成、释放、运输、代谢、结合及消除等过程,进而破坏内稳态以及生殖、发育调节的外源性物质。其来源极为广泛,涵盖了除草剂、杀虫剂、防腐剂、杀菌剂、塑料增塑剂、洗涤剂、化妆品、阻燃剂以及化工副产品等众多人类生产生活中接触的化学制品。
随着全球工业化和现代化进程的迅猛推进,大量化学物质被排放到环境中,EEDs的种类和数量与日俱增,对生态环境和人类健康构成了严重威胁。诸多研究表明,EEDs与人类生殖障碍紧密相关,如导致男性精子数量减少、质量下降,女性月经紊乱、不孕不育等问题;还会引发发育异常,包括胎儿畸形、儿童性早熟等;并且与代谢紊乱,像肥胖、糖尿病等,以及某些癌症,如乳腺癌、睾丸癌、前列腺癌等的发生存在密切联系。在生态环境方面,EEDs会干扰野生动物的内分泌系统,致使其生殖能力下降、种群数量减少,甚至影响整个生态系统的平衡与稳定。
传统的EEDs检测方法主要包括体内实验和体外实验。体内实验虽能相对真实地反映EEDs对生物体的干扰效应,但存在耗资大、耗时久、耗力多的问题,不适用于批量测试和现场应用,在环境低浓度暴露时,也难以获得准确的评价结论,同时还易受实验动物年龄、性别、品系、营养状况、个体差异及取样、称重误差等因素干扰。体外实验虽然具有快速、简便和经济的优势,适用于大规模、低浓度EEDs的筛检,然而其检测结果与生物体实际暴露情况可能存在偏差,无法全面反映EEDs在复杂环境中的综合效应。
机器学习作为人工智能领域的关键技术,能够从大量数据中自动学习特征和模式,实现对未知数据的准确预测和分类。在EEDs预测领域,机器学习具有显著优势。一方面,它能够处理海量的化学物质数据,快速筛选出潜在的EEDs,大大提高了筛选效率;另一方面,通过对分子结构等多维度数据的分析,机器学习模型可以挖掘出传统方法难以发现的结构-活性关系,提升预测的准确性和可靠性。将机器学习方法应用于基于分子结构预测潜在的EEDs,有助于在大量化学物质中快速、准确地识别出可能具有内分泌干扰效应的物质,为环境监测、风险评估和化学物质管理提供科学依据,对于预防和减少EEDs对生态环境和人类健康的危害具有重要的现实意义。
1.2国内外研究现状
在国外,环境内分泌干扰物的研究起步较早,美国、欧盟、日本等国家和地区投入了大量资源进行相关研究。美国环保局(EPA)早在1998年就提出了内分泌干扰物筛选计划(EDSP),旨在建立一套科学的筛选和测试方法,以评估化学物质的内分泌干扰效应。欧盟也制定了一系列相关政策和法规,如《化学品注册、评估、授权和限制法规》(REACH),对化学品的安全性进行严格监管。在机器学习应用方面,国外学者进行了诸多探索。例如,有研究利用定量构效关系(QSAR)和机器学习方法预测雄激素受体(AR)结合力,取得了较高的灵敏度(94.7%)和特异性(81.1%)。还有学者构建了多种机器学习模型,如深度森林(DF)、随机森林和人工神经网络,用于快速预测AR激动剂,从NORMAN水相关数据集中筛选出了可疑的AR激动剂清单。
国内对于环境内分泌干扰物的研究近年来也取得了显著进展。科研人员在EEDs的检测技术、环境暴露水平、毒理效应等方面开展了大量工作。在机器学习应用于EEDs预测领域,国内学者也进行了积极尝试。有研究通过分析化学物质的结构和功能团,利用机器学习模型识别与内分泌干扰活性相关的特征,预测未知化学品的生物效应。然而,当前国内外研究仍存在一些不足之处。在数据方面,高质量、大规模的EEDs数据集相对匮乏,且数据的一致性和可靠性有待提高;在模型方面,机器学习模型的泛化能力和可解释性有待进一步增强,不同模型之间的比较和优化研究还不够充分;在应用方面,机器学习预测结果与实际环境监测和风险评估的结合还不够紧密,缺乏有效的验证和应用案例。
1.3研究内容与方法
本研究旨在基于机器学习方法,利用分子结构信息预测潜在的环境内分泌干扰物。具体研究内容包括:收集和整理环境内分泌干扰物相关数据,构建高质量的数据集,涵盖已知EEDs的分子结构、理化性质以及内分泌干扰活性等信息;对数据进行预处理,包括数据清洗、特征提取和选择等,将分子结构转化为适合机器学习模型输入的特征向量;选择合适的机器学习算法,如支持向量机、随机森林、神经网络等,构建预测模型
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