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巢式RT-PCR与FISH联合:儿童ALL常见融合基因精准检测新策略

一、引言

1.1研究背景与意义

急性淋巴细胞白血病(ALL)是儿童时期最为常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着儿童的生命健康和生活质量。据统计,ALL占儿童血液系统肿瘤的70%以上,其中又以B-细胞ALL最为常见。该疾病的发病机制极为复杂,而融合基因的出现被认为是导致癌症发展的关键因素之一。常见的ALL融合基因如TEL-AML1、E2A-PBX1、MLL-AF4等,在ALL的发生、发展过程中扮演着重要角色。这些融合基因的存在不仅影响白血病细胞的生物学特性,还与疾病的预后密切相关。

准确检测ALL患儿是否存在融合基因,对于疾病的诊断、预后评估及治疗方案的制定都具有不可估量的意义。在诊断方面,融合基因检测能够为疾病确诊提供更为精准的分子层面依据,有助于与其他血液疾病进行鉴别诊断,避免误诊和漏诊。在预后评估中,不同的融合基因类型往往预示着不同的疾病发展趋势和治疗反应,例如某些融合基因阳性的患儿可能具有更高的复发风险,而另一些则可能对特定治疗方案更为敏感,这为医生预测患儿的预后情况提供了关键信息。在治疗方案制定上,融合基因检测结果能够指导医生选择最适宜的治疗手段,实现精准治疗,提高治疗效果,减少不必要的治疗损伤和医疗资源浪费。

巢式逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)是检测融合基因的常用技术之一,它具有较高的灵敏度,能够检测出极低水平的已知融合基因转录本。然而,该技术的局限性在于仅能检测已知的融合基因,对于那些尚未被发现或报道的未知融合基因则无能为力。荧光原位杂交(FISH)是一种能够直接观察细胞中染色体结构与数量的分析技术,它尤其适用于检测染色体易位等结构变异,可用于未知融合基因的检测。通过将荧光标记的核酸探针与细胞内的染色体或DNA进行杂交,FISH能够直观地显示出染色体的异常变化,从而发现潜在的融合基因。

将巢式RT-PCR和FISH联合应用于ALL融合基因的检测,具有显著的优势。两者的结合能够实现优势互补,巢式RT-PCR负责检测已知融合基因,确保对常见融合基因的准确识别;FISH则专注于检测未知融合基因,填补了巢式RT-PCR在这方面的空白。这种联合检测方法能够提高对于ALL常见和未知融合基因的检测效率和准确性,为ALL的早期诊断、预后评估及治疗方案制定提供更全面、更可靠的支持,具有极高的临床应用价值。

1.2国内外研究现状

在国外,对于儿童ALL融合基因检测的研究开展较早,并且取得了丰硕的成果。多项大规模的临床研究对各种融合基因在儿童ALL中的发生率、临床特征及预后意义进行了深入探讨。例如,美国儿童肿瘤协作组(COG)的研究表明,TEL-AML1融合基因在儿童ALL中的阳性率约为20%-25%,并且该融合基因阳性的患儿通常具有较好的预后。同时,国外在融合基因检测技术的研发和应用方面也处于领先地位,不断有新的检测方法和技术涌现,如基于二代测序技术的融合基因检测平台,能够同时检测多种已知和未知的融合基因,大大提高了检测的通量和准确性。

在国内,随着医疗技术的不断进步和对儿童ALL研究的逐渐深入,对于融合基因检测的重视程度也日益提高。许多大型医院和科研机构开展了相关研究,对我国儿童ALL患者的融合基因谱进行了分析。研究发现,我国儿童ALL中常见融合基因的分布与国外报道存在一定的差异,这可能与种族、环境等因素有关。在检测技术方面,巢式RT-PCR和FISH等传统技术已广泛应用于临床实践,并且在一些研究中尝试将多种技术联合应用,以提高检测的准确性。例如,有研究将巢式RT-PCR、FISH和免疫分型技术相结合,对儿童ALL进行综合诊断,取得了较好的效果。

关于巢式RT-PCR和FISH联合应用检测儿童ALL融合基因的研究,国内外均有相关报道。这些研究一致表明,联合检测方法能够显著提高融合基因的检出率,为ALL的诊断和治疗提供更有力的支持。然而,目前的研究仍存在一些不足之处,如对于联合检测方法的最佳应用模式和流程尚未达成共识,不同研究之间的检测结果存在一定的差异,这可能与实验条件、样本选择等因素有关。此外,对于联合检测结果的临床解读和应用,还需要进一步的研究和探讨,以更好地指导临床实践。

1.3研究目的与创新点

本研究旨在深入探究巢式RT-PCR和FISH联合应用于儿童ALL常见融合基因检测的效果,具体包括以下几个方面:首先,通过对大量ALL患儿样本的检测,准确评估联合检测方法对常见融合基因TEL-AML1、E2A-PBX1、MLL-AF4等的检出率,与单一检测方法进行对比,明确联合检测的优势;其次,分析联合检

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