WGCNA联合拟时序分析筛选十二指肠乳头腺瘤关键驱动和复发预测基因SLC12A2.pdfVIP

胃肠病学2025年第30卷第2期·73·

WGCNA联合拟时序分析筛选十二指肠乳头腺瘤

关键驱动和复发预测基因SLC12A2*

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蒋成飞王频蔡培韦晶晶王雷邹晓平

南京大学医学院附属鼓楼医院消化内科（210008）

背景：十二指肠乳头腺瘤是一种良性肿瘤，发病率较低但癌变风险较高。尽管内镜下乳头切除术创伤小、并发

症少，但存在一定的复发风险。探索该病的驱动基因，预测其复发和癌变风险，有助于实现精准治疗。目的：基于

转录组数据，整合多维度生物信息学方法筛选驱动十二指肠乳头腺瘤发生、发展和预测复发的关键基因并进行临

床验证。方法：从GEO数据库获取十二指肠乳头腺瘤和腺癌表达谱数据（GSE189035、GSE94919、GSE111156、

GSE102208），筛选腺瘤与正常组织的差异表达基因（DEGs），结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）与拟时序分

析识别在正常组织‐腺瘤‐腺癌演进过程中呈“先升后降”表达趋势的关键基因。通过基因功能注释、免疫微环境分

析、蛋白质相互作用网络分析探究筛选出的关键基因的作用机制，并通过临床样本免疫组化染色验证基因表达特

征及其与复发的关系。结果：共筛选出469个DEGs。WGCNA显示蓝色模块（1051个基因）与腺瘤发生和进展相关

（正常、腺瘤和腺癌组织Cor分别为-0.29、0.15和0.11），与DEGs取交集得到SLC12A2、BEST4、SLC37A2、SOAT2四个

关键基因，拟时序分析显示仅SLC12A2基因在腺瘤和腺癌组织中呈持续高表达。KEGG富集分析提示SLC12A2与

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多种恶性肿瘤相关信号通路如PD‐1/PD‐L1存在关联，且其高表达与免疫细胞（γδT细胞、CD8T细胞等）浸润减少

相关。临床样本免疫组化分析证实SLC12A2在正常、腺瘤、腺癌组织中的表达呈现先升高后降低趋势，腺瘤复发患

者表达水平更高（P=0.004），SLC12A2高表达组复发风险增加（P=0.034）。结论：SLC12A2是驱动十二指肠乳头腺瘤

发生、发展的关键基因，有望成为预测肿瘤复发的生物学标志物。

关键词十二指肠乳头腺瘤；SLC12A2；加权基因共表达网络分析；拟时序分析；生物学标记

ScreeningofKeyDriverandRecurrencePredictionGeneSLC12A2inDuodenalPapillaryAdenomavia

WGCNACombinedWithPseudo‐timeAnalysisJIANGChengfei,WANGPin,CAIPei,WEIJingjing,WANGLei,

ZOUXiaoping.DepartmentofGastroenterology,NanjingDrumTowerHospital,theAffiliatedHospitalofNanjingUniversity

MedicalSchool,Nanjing(210008)

Correspondenceto:ZOUXiaoping,Email:zouxp@

Background:Duodenalpapillaryadenomaisabenigntumorwith