系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的关键基因分析.pdfVIP

Biophysics生物物理学,2024,12(1),9-21

PublishedOnlineFebruary2024inHans./journal/biphy

/10.12677/biphy.2024.121002

系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的

关键基因分析

1112*21*

董斐雅，侯甜甜，董佳琪，张晓炜，刘暘，樊国梁

1内蒙古大学物理科学与技术学院，内蒙古呼和浩特

2内蒙古医科大学第一附属医院风湿免疫科，内蒙古呼和浩特

收稿日期：2023年11月21日；录用日期：2024年2月19日；发布日期：2024年2月23日

摘要

系统性红斑狼疮(SLE)是一种自身免疫性疾病，表观遗传变异在SLE的发病机制中起重要作用。已有研究

证明，异常DNA甲基化发生在SLE发展的各个过程中，调控相关基因表达水平。因此，寻找受影响的关

键基因有助于SLE的诊断和治疗。首先，本文从GeneExpressionOmnibus(GEO)数据库中下载了基因

表达数据和DNA甲基化数据，利用生物信息学的方法，对在外周血单核细胞(PBMC)的基因表达和DNA

甲基化数据进行差异分析，甲基化差异表达的基因被记录为差异甲基化基因(DMG)与差异表达基因(DEG)

之间的重叠基因。使用DAVID数据库对受甲基化影响基因(mDEG)的功能富集分析。然后使用STRING数

据库构建蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络以获得参与SLE的关键基因。之后，本研究利用受试者工作

特征(ROC)曲线评估hub基因，以验证其区分SLE与健康对照组的能力。最后，我们构建了一个hub基因

-miRNA网络，并对共享基因进行了功能富集。

关键词

生物信息学，DNA甲基化，基因表达，关键基因

AnalysisforKeyGenesAffectedbyDNA

MethylationinSystemicLupus

Erythematosus

1112*21*

FeiyaDong,TiantianHou,JiaqiDong,XiaoweiZhang,YangLiu,GuoliangFan

1

SchoolofPhysicalSciencesandTechnology,InnerMongoliaUniversity,HohhotInnerMongolia

2

DepartmentofRheumatology,theFirstAffiliatedHospital,InnerMongoliaMedicalUniversity,HohhotInner

Mongolia

*通讯作者。

文章引用:董斐雅,侯甜甜,董佳琪,张晓炜,刘暘,樊国梁.系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的关键基因分析[J].

生物物理学,2024,12(1):9-21.DOI:10.12677/biphy.2024.121002

董斐雅等

stthrd

Received:Nov.21,2023;accepted:Feb.19,2024;published:Feb.23,2024

Abstract

Systemiclupuserythematosus(SLE)isanautoimmunedisease.Epigeneticvariationplaysanim-

portantroleinthepathogenesisofSLE.Studieshaveshownthatabnor