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基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdfVIP

基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdf

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    232JModUrol,Vol.29No.3Mar.2024

    ·前列腺癌专题·

    基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性IncRNA表达及临床意义

    陈平舟,许清江，林煌，黄翔²,吴翔1

    （1.福建省立医院泌尿外科，福建福州350004；2.福建医科大学附属南平市第一医院泌尿外科，福建南平353000）

    Analysisoftheexpressionandclinicalsignificanceofprostatecancertissue-specific

    IncRNAsbasedonbioinformaticsdatabases

    CHENPingzhou,XUQingjiang,LINHuang,HUANGXiang,WUXiang

    (1.DepartmentofUrology,FujianProvincialHospital,Fuzhou350004;2.DepartmentofUrology,Nanping

    FirstHospitalAffiliatedtoFujianMedicalUniversity,Nanping353000,China)

    ABSTRACT:ObjectiveToexploretheexpressionandclinicalsignificanceofprostatecancertissue-specificIncRNAs.

    MethodsThegenedifferencesof492prostatecancertissuesand152adjacenttissuesinTCGAandGEOgenomicdatabases

    wereanalyzedwithbioinformaticsmethods.Atotalof5lncRNAswerescreenedout,andtheirspecificityinprostatetissuesand

    impactontheprognosisofpatientswereanalyzed.ResultsThe5IncRNAsincludedPCAT14,PCA3,CTBP1-AS,DRAIC,

    andGPC5-AS1.PCAT14andPCA3werespecificallyexpressedinprostatecancertissues,andelevatedexpressionwasrelatedto

    theprognosis.Moreover,theywerewellcorelatedwithprostatecancer-specificantigenssuchasKLK3,AMACR,SLC45A3,

    andsoon.GOfunctionenrichmentanalysisandKEGGpathwayenrichmentanalysisshowedthatthedifferentialexpressionof

    PCA3wascloselyrelatedtophagocytosis,cellrecognition,defenseresponsetobacteria,immunoglobulincomplex,Golgi

    apparatus,antigenbinding,chemokinereceptorbinding,whitematterdigestionandabsorption,renin-angiotensinsystemand

    othersignalingpathways,whilethedifferentialexpressionofPCAT14wascloselyrelatedtotheactivityofGolgiapparatusand

    ionchannels,reninsecretion,cAMPsignalingpathway,andgonadotropinsecretion-relatedsignalingpathway.ConclusionPCA3

    andPCAT14arespecificallyexpressedinpros

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