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DOI:10.19500/ki.0367-6358研究论文
化学世界
ChemicalWorldARTICLE
利用CoMFA和CoMSIA对氟乐灵抗体识别特异性进行
3D-QSAR分析
李嘉宜“,姚茜“,黄惠威“,施迪桑“,刘凤银“,
*a
黄新安,袁学文“,杨剑萍“,穆洪涛
(广东第二师范学院生物与食品工程系,广东广州510303)
(广州中医药大学中药学系,广东广州510405)
摘要:为了探究氟乐灵多克隆抗体PcAb-2C识别特异性与药物分子三维结构的定量关系,利用PcAb-2C
的交叉反应数据,选取比较分子力场分析法(CoMFA),比较分子相似指数法(CoMSIA)进行三维定量构效
关系(3D-QSAR)研究,并建立相应的模型。结果表明:CoMFA模型的交叉验证系数(r%)为0.497,非交叉
验证系数(rnev)为0.999;CoMSIA模型的交叉验证系数(r)为0.498,非交叉验证系数(rnev)为0.979。
CoMFA模型中立体场和静电场的贡献值分别为63.10%和36.90%,CoMSIA模型中疏水场、静电场和立
体场的贡献值分别为54.90%、38.40%和6.70%。各力场的贡献比例表明基团的疏水作用对化合物影响
较大,推测出抗原疏水性的增强特别是N,N-二丙基部位的疏水性增强,有利于诱导出亲和力更强的抗体,
为设计氟乐灵半抗原提供了信息。
关键词:氟乐灵;多克隆抗体;比较分子力场分析法;比较分子相似性指数分析
中图分类号:TQ463文献标志码:A
3D-QSARAnalysisofTrifluralinAntibodyRecognitionSpecificity
UsingCoMFAandCoMSIA
LiJiayi
HuangXinan
(aGuangdongUniversityofEducation,Guangzhou,Guangdong510303,China)
(°ArtemisininResearchCenter,GuangzhouUniversityofChineseMedicine,
Guangzhou,Guangdong510405,China)
Abstract:Toinvestigatethequantitativerelationshipbetweentherecognitionspecificityoftrifluralin
polyclonalantibodyPcAb-2Candthree-dimensionalstructureofdrugmolecules,thecross-reactivitydataof
PcAb-2Cwerecollectedinthispaper.Thethree-dimensionalquantitativestructure-activityrelationship
(3D-QSAR)wasstudiedinthisresearchbycombiningmolecularforcefieldanalysis(CoMFA)and
comparativemolecularsimilarityindex(CoMSIA),andthenamatchingmodelwasdeveloped.T
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