糖尿病肾脏病microRNA-mRNA-信号通路调控网络构建与生物学靶点的筛选分析.pdfVIP

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系统医学2025年5月第10卷第9期基础医学系统研究

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DOI:10.19368/ki.2096-1782.2025.09.033

糖尿病肾脏病microRNA-mRNA-信号通路

调控网络构建与生物学靶点的筛选分析

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张孟贤,黄国海

1.东莞市虎门医院肾内科,广东东莞523000;2.汕头市中心医院肾内科,广东汕头515000

[摘要]目的应用生物信息学技术构建并分析糖尿病肾脏病(diabetickidneydisease,DKD)的microRNA-

mRNA-信号通路调控网络,并寻找与疾病相关的生物学靶点。方法下载基因芯片数据集GSE30528与

GSE51674,筛选DKD的差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs)与差异表达microRNA(differen‐

tiallyexpressedmicroRNA,DEMs),利用DAVID、STRING在线平台、及Cytoscape对筛选所得的DEGs进行注释

及富集分析、可视化及蛋白质-蛋白质相互作用网络分析。使用DIANATools预测DEMs的靶基因,并结合

DrawVenn获得DEGs与DEMs靶基因的交集基因,最后运用Cytoscape软件绘制microRNA-mRNA-信号调节

网络,筛选关键的生物学靶点。结果从数据集GSE30528筛选出704个DEGs。从数据集GSE51674筛选出

上调的16个DEMs预测靶基因4431个,下调的7个DEMs预测靶基因2617个。DEMs靶基因与DEGs获得交

集基因36个,运用Cytoscape绘制microRNA-mRNA-信号调节网络,其中FN1、VCAN是关键基因,富集于黏着

斑信号通路,且与hsa-let-7b-5p关联密切。结论通过构建microRNA-mRNA-信号通路调控网络展示DKD

基因表达模式及其相互作用,本研究发现hsa-let-7b-5p调控的靶基因FN1、VCAN,及其富集的黏着斑信号

通路可能在DKD发生发展的具有重要作用,值得进一步关注与研究。

[关键词]糖尿病肾脏病;调控网络;生物学靶点

[中图分类号]R4[文献标识码]A[文章编号]2096-1782(2025)05(a)-0033-06

ConstructionofmicroRNA-mRNA-signalingPathwayRegulatoryNet‐

workandScreeningAnalysisofBiologicalTargetsinDiabeticKidneyDis‐

ease

12

ZHANGMengxian,HUANGGuohai

1.DepartmentofNephrology,HumenHospitalofDongguan,Guangdong523000,Guangdong,China;2.Departmentof

Nephrology,ShantouCentralHospital,Shantou515000,Guangdong,China

[Abstract]ObjectiveToconstructandanalyzethemicroRNA-mRNA-signal

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