计算机辅助多肽药物设计的应用：从结构预测到模拟优化.pdfVIP

第44卷第2期延安大学学报（自然科学版）Vol.44No.2

2025年6月JournalofYan’anUniversity（NaturalScienceEdition)Jun.2025

引用格式：姜鸣，谢润泽，杨亮，等.计算机辅助多肽药物设计的应用：从结构预测到模拟优化［J］.延安大学学报（自然科学版），

2025，44（2）：63-70.［JIANGM，XIERZ，YANGL，etal.Applicationsofcomputer-aidedpeptidedrugdesign：fromstructure

predictiontosimulationoptimization，2025，44（2）：63-70.］DOI：：10.13876/J.cnki.ydnse.250007

计算机辅助多肽药物设计的应用：

从结构预测到模拟优化

1，211，21，2*

姜鸣，谢润泽，杨亮，白占涛

（1.延安大学生命科学学院；2.延安市多肽资源药物工程技术研究中心，陕西延安716000）

摘要：计算机辅助药物设计（computer-aideddrugdesign，CADD）通过整合计算建模与人工智能

技术，凭借其高效预测、精准筛选及显著经济性优势，在多肽药物研究中占据重要地位。本文系统

评述了CADD在多肽结构预测、作用机制解析和人工多肽药物设计中的应用，揭示了CADD技术在

提高多肽药物发现成功率、优化药物特性和降低研发成本方面的关键作用，为多肽药物研发提供

了新的策略和方向，助推多肽药物的发现与研究。

关键词：计算机辅助药物设计；多肽；模型预测；分子对接；分子动力学模拟

中图分类号：R914.2文献标志码：A文章编号：1004-602X（2025）02-0063-08

自20世纪胰岛素被发现以来，便进入了多肽工多肽理性设计提供了理论基础（图1）。在人工

［1］

药物研发的黄金时代，已有超过80种肽类药物智能（Artificialintelligence，AI）高速发展的时代，

［2-3］

被批准用于治疗多种疾病。与传统的小分子CADD技术通过融合深度学习算法与多组学数据

药物相比，多肽类药物因其高选择性、低毒性及强等，可系统性提升多肽药物的药靶识别效率与成

效性，在疾病治疗中占据重要地位。如靶向PD-1/药性优化的成功率。本文综述了近年来多肽药物

PD-L1的抗癌肽（如Pembrolizumab偶联肽）在肿瘤研发中CADD技术的应用，旨在为药物研发人员

免疫治疗中展现出显著疗效。然而，多肽药物的提供方法论指导，加速多肽药物的发现与应用。

复杂结构、短半衰期及高研发成本限制了其广泛

1在多肽类药物及靶点结构解析中的应用

［4-5］

应用。

计算机辅助药物设计（computer-aideddrug多肽的功能与其三维结构密切相关。传统实

design，CADD）技术的出现为多肽药物的研发提供验方法