宁夏枸杞LbDXS基因家族全基因组鉴定及表达分析.pdfVIP

第45卷第8期中南林业科技大学学报Vol.45No.8

2025年8月JournalofCentralSouthUniversityofForestryTechnologyAug.2025

Doi:10.14067/ki.1673-923x.2025.08.016http://

宁夏枸杞LbDXS基因家族全基因组鉴定

及表达分析

111111，2

戚传鑫，张磊，王博涛，曹杰，马亚平，曹兵

（1.宁夏大学a.葡萄酒与园艺学院；b.林业与草业学院，宁夏银川750021；

2.宁夏葡萄酒与防沙治沙职业技术学院，宁夏银川750100）

DXS

摘要：【目的】基于枸杞全基因组对枸杞红素合成相关基因进行基因家族鉴定，分析其在宁夏枸杞果实

发育期的表达特征，为解析枸杞红素生物合成提供候选基因。【方法】以枸杞全基因组数据和转录组数据为基

础，通过生物信息学方法鉴定LbDXS基因家族，分析其序列特征、基因结构、氨基酸理化性质、蛋白质保守

结构域、家族系统进化关系等特征，解析其在宁夏枸杞不同发育期、不同器官及果实发育阶段中的表达模式。

【结果】共鉴定到7个LbDXS基因家族，序列特征分析表明其均包含DXS保守结构域，进化树分析聚为4类，

其中分组1家族成员最多，7个LbDXS基因主要分布在5条染色体上。多物种进化树分析表明其与茄科家族成

员进化保守，推测其在遗传进化中功能相近。启动子顺式作用元件分析表明，LbDXS基因启动子区域包含与光

响应、激素、环境胁迫等相关响应元件。种间共线性分析表明LbDXS基因在茄科的进化中具有相似功能。在宁

LbDXS2LbDXS3LbDXS4

夏枸杞不同发育时期中的表达分析结果表明，在宁夏枸杞青果期至完熟期、、表达量

显著升高，表明其可能对宁夏枸杞红素积累起重要作用。【结论】基于枸杞全基因组鉴定到7个LbDXS基因家

LbDXS2LbDXS3

族成员，其均包含DXS保守结构域，进化分析推测其在茄科家族物种中功能相近，其中、、

LbDXS4在宁夏枸杞青果期至完熟期阶段显著表达，表明其在枸杞红素生物合成中具有潜在的调控功能。

关键词：宁夏枸杞；LbDXS基因家族；表达分析

中图分类号：S718.43；S663.9文献标志码：A文章编号：1673-923X(2025)08-0154-13

Genome-wideidentificationandexpressionanalys