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- 2025-12-22 发布于江西
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江苏农业科学2025年第53卷第14期—33—
李晓静,鲁海菊,张彭倩,等.石榴OFP基因家族的全基因组鉴定与表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(14):33-43.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2025.14.005
石榴OFP基因家族的全基因组鉴定与表达分析
111112
李晓静,鲁海菊,张彭倩,陈仕艳,蔡怡婷,岳亮亮
(1.红河学院生物科学与农学学院,云南蒙自661100;2.西南林业大学高原湿地中心,云南昆明650224)
摘要:卵形家族蛋白(ovatefamilyproteins,OFP)转录因子在植物体生长发育过程和对胁迫的响应中起着重要作
用。以石榴基因组数据为基础,利用生物信息学方法开展OFP基因家族成员的鉴定及染色体定位、蛋白理化性质、系
统进化关系、保守基序、基因结构、顺式作用元件及表达模式分析。结果表明,从石榴基因组中共鉴定到17个OFP基
因,分布在除4号、7号染色体外的其他6条染色体上,其中5号染色体上分布的基因最多,分别有PgOFP10、
PgOFP11、PgOFP12、PgOFP13和PgOFP14。17个OFP基因可划分为3个亚家族。PgOFP基因的结构相对简单,大多
数基因没有内含子,而PgOFP2、PgOFP6和PgOFP15只有1个内含子。17个PgOFP基因的启动子区域含有大量植
物激素响应及逆境应答相关的顺式作用元件。表达分析结果表明,PgOFP15在根、叶片中高表达,推测PgOFP15在叶
片、根发育过程中起重要作用。PgOFP1在大多数的组织中高表达,并且随着果皮的发育,其相对表达量呈逐渐升高
的趋势,推测PgOFP1有可能在石榴果皮发育中起到重要作用。17个石榴OFP基因在NaCl盐胁迫的样品中表现出
差异表达。PgOFP1、PgOFP6、PgOFP8在大多数盐胁迫样品中高表达。在受到盐胁迫后,PgOFP1的相对表达量在处
理后3d的根中达到高峰,在处理后3d的叶片中达到最低值。喷施不同浓度的ABA后,PgOFP2、PgOFP9、PgOFP7
在部分ABA处理的样品中不表达,PgOFP1、PgOFP6在所有样品中高表达。由研究结果可以推测,PgOFP基因家族
可能在响应逆境胁迫中发挥着重要作用。
关键词:石榴;OFP基因家族;表达分析;全基因组;逆境胁迫
中图分类号:S665.401文献标志码:A文章编号:1002-1302(2025)14-0033-10
石榴(PunicagranatumL.)为石榴科石榴属果protein,即卵形家族蛋白),是一类植物特异性转录
树,是重要的功能性水果[1]。石榴果实中富含类黄调控蛋白,在植物的生长发育、应对逆境胁迫中起
酮、鞣花单宁等酚类物质,具有抗炎、抗动脉粥样硬到重要作用[2-6]。OVATE基因最早是在番茄中被
化、抗糖尿病、抗乳腺癌、抗前列腺癌、抗结肠癌等发现的,人们将它定义为可控制番茄果实形状的基
效果,其保健功能较强,同时也具有重要的观赏价因。如果OVATE基因中提前出现终止密码子的变
值。云南蒙自是我国八大石榴产区之一。蒙自石异,会使番茄果实形状由圆形变成梨形,而当它过
[7]
榴因具有色泽鲜艳、籽粒饱满、粒大核软、晶莹剔量表达时,又会抑制番茄的生长。
透、固形物含量高、风味浓郁、汁多爽口、可食率高近年来,随着生物信息学、基因组学的发展,对
和成熟早等特点而名扬中外。但是近年来,蒙自石OFP转录因子的研究也逐渐增多,研究者在亮叶
[8][9][7][6][4][10]
榴的品质有所下降,好果率变
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