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第44卷第5期中南林业科技大学学报Vol.44No.5

2024年5月JournalofCentralSouthUniversityofForestryTechnologyMay2024

Doi:10.14067/ki.1673-923x.2024.05.017http://

青冈栎原花青素合成基因的鉴定与分析

12111

曹睿彬,杨俊杰,罗常莎,姜小龙,徐刚标

(1.中南林业科技大学林木遗传育种实验室,湖南长沙410004;

2.湖南省青羊湖国有林场,湖南宁乡410600)

摘要:【目的】对青冈栎原花青素(缩合单宁)合成基因进行鉴定及生物信息学分析,可为青冈栎果实资源

开发利用和品种改良奠定分子基础。【方法】基于已公布的青冈栎全基因组测序数据,利用生物信息学方法对

原花青素合成基因进行鉴定,并分析其蛋白质序列、染色体定位、种间共线性、基因结构及系统发育关系。

【结果】青冈栎中11种原花青素合成基因有42个家族成员,分布在11条染色体上;蛋白质理化性质在具有

多拷贝数的QgPAL、QgC4H、Qg4CL、QgF3′H基因家族成员间存在差异;Qg4CL8、Qg4CL14、Qg4CL17、

QgF3H2、QgC4H4蛋白具有2~3个跨膜区域,表明这些蛋白可能在细胞内外信号转导中发挥重要作用;

基因家族成员在栎属中进化比较保守,通过栎属古老的全基因组复制及串联重复和片段重复扩张;QgPAL2~

QgPAL6Qg4CL15AtPAL12At4CL3

和基因分别与拟南芥中参与原花青素合成的~和聚为同一分支,可能在原

花青素生物合成中发挥重要作用;Qg4CL基因家族在系统发育树中进化出新的分支,其家族成员表现出基因结

构的多样性,并在4CL基因的高度保守基序中发生氨基酸位点的突变,推测这些基因可能因进化出新功能而被

保留下来。【结论】青冈栎原花青素合成基因通过多种复制方式进行扩张,复制基因在栎属中相对保守,在青

冈栎中表现出理化性质、蛋白结构和进化模式的多样化。采用生物信息学方法分析了原花青素合成基因的特征

和进化模式,这为深入解析栎属植物单宁合成机制奠定了分子基础。

关键词:青冈栎;原花青素合成基因;生物信息学;进化特征

中图分类号:S718.43文献标志码:A文章编号:1673-923X(2024)05-0167-14

Identificationandanalysisofproanthocyanidinsynthesisgenes

inQuercusglauca

12111

CAORuibin,YANGJunjie,LUOChangsha,JIANGXiaolong,XUGangbiao

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