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实时荧光定量PCR技术在肿瘤分子病理检测中的应用
Contents目录样本选择与前处理检测流程与结果分析质量控制常见问题与处理建议
样本选择与前处理
010203强烈推荐使用手术切除组织或活检组织FFPE样本细胞学样本作为替代选择外周血等体液样本作为最后选择在肿瘤分子病理检测中,应优先选择手术切除组织或活检组织的福尔马林固定石蜡包埋样本,以确保检测结果的准确性和可靠性。当无法及时获取手术切除组织或活检组织时,可选用细胞学样本进行检测,尤其是制备成细胞蜡块后,其处理及检测方式与组织样本相似。若组织和细胞学样本均不可及,则推荐使用外周血等体液样本进行循环肿瘤DNA(ctDNA)突变检测,但需注意假阴性风险。手术切除组织或活检组织推荐
细胞蜡块制备涂片与液基制片浆膜腔积液离心处理强烈推荐将细胞学样本制备成细胞蜡块,使用4%中性甲醛或95%乙醇固定液进行固定。对于质控合格的细胞学样本,可涂片或液基细胞学制片,镜下评估肿瘤细胞数量及比例。浆膜腔积液离心后的上清液可作为补充检测样本,用于分子病理检测,但需关注假阴性风险。细胞学样本的制备和保存
010203外周血ctDNA的定义与重要性外周血ctDNA的采样方法外周血ctDNA突变检测的优势循环肿瘤DNA(ctDNA)是从血液中检测到的来自肿瘤细胞的DNA片段,对癌症的早期诊断和治疗监测具有重要意义。通过使用含有游离DNA保护剂和防细胞裂解剂的专用采血管采集不少于10ml的全血,然后进行血浆分离以提取ctDNA。利用qPCR技术对外周血中的ctDNA进行突变检测,具有操作简便、耗时短、灵敏度高的优点,适用于无法获取组织样本的情况。外周血ctDNA突变检测
检测流程与结果分析
010203吸附柱法利用特殊材料吸附核酸,适用于大多数样本类型。磁珠法通过磁性颗粒捕获核酸,适合高纯度核酸提取。推荐使用经NMPA注册/备案的商品化试剂盒,确保性能稳定。吸附柱法磁珠法商品化试剂盒与自建试剂选择核酸提取方法的选择
核酸的质量和纯度是qPCR检测结果准确可靠的基础。推荐使用紫外分光光度计进行检测,确保DNA和RNA的A260/280比值在规定范围内。核酸提取与质量评估强烈推荐采用经NMPA注册/备案的商品化试剂盒进行qPCR检测,并根据试剂盒说明书和实验室实际情况建立SOP。加样时避免气泡和核酸机械损伤,扩增完成后先确认阴性质控和阳性/弱阳性质控是否在控,再分析样本检测结果。qPCR检测流程与结果分析各医疗机构应根据实际情况,设置符合规范的结果报告模版,由病理医师和分子检测人员协同及时、准确地完成分子病理诊断报告,为患者诊疗提供参考。检测报告出具qPCR检测与结果分析
患者及样本信息检测项目与方法检测结果与局限性说明报告应包括患者的姓名、性别、年龄等基本信息,以及样本来源、接收时间和病理质控信息。报告需明确指出检测的基因变异位点,使用的qPCR试剂盒及其性能参数,如敏感度和特异度。报告应详细列出检测到的基因变异位点和结果,同时注明检测的责任范围及可能存在的局限性。检测报告内容及审核
质量控制
010302准确度验证检出限验证精密度验证通过使用标准品和已知结果的临床样本进行验证,评估阳性符合率和阴性符合率。使用已知浓度的标准品进行梯度稀释至检出限浓度,重复测定多次,以确认稳定性。包括重复性和重现性两个方面,使用一定数量的临床样本或标准品在不同条件下进行多次检测。试剂性能验证
质控品的选择和使用质控品的分装与保存失控分析与纠正措施室内质控品应选择商品化或自制质控品,确保其制备和验证程序及记录的完整性。质控品在使用时应注意分装,避免反复冻融,以保证检测结果的稳定性和准确性。当室内质控结果失控时,需立即进行失控分析并采取相应的纠正和预防措施,防止问题再次发生。室内质控的实施
室间质评的重要性提高检测一致性识别并纠正偏差提升实验室信誉通过参加室间质评,实验室可以验证自身检测结果的一致性和准确性。室间质评帮助实验室发现检测方法中的系统偏差,及时进行修正。定期参加室间质评并通过评估,可增强实验室在行业内的信誉和认可度。
常见问题与处理建议
010203肿瘤细胞含量评估核酸提取过程优化保存年限和前处理对于FFPE样本,应使用病理医师评估肿瘤细胞含量不少于200个且占比不低于20%,避免使用强酸脱钙处理后的样本。核酸提取过程中操作不规范,如脱蜡不彻底、乙醇挥发不彻底等,均会影响qPCR检测的准确性。样本前处理不当或保存年限过长,会导致提取的核酸质量不佳,影响qPCR检测。样本质量问题的解决
010203扩增曲线翘尾扩增曲线下弯、弯折部分孔位曲线异常常见原因是污染和非特异性扩增,需通过优化实验条件或更换试剂盒进行解决。可能涉及仪器、耗材、试剂及实验流程等方面问题,需要详细检查和调
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