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J.SHANXIAGRIC,UNIV.(NaturalScienceEdition)
学报(自然科学版)04191
2023,43(3)023
:
段利强,程天佑,张甜甜,等.黄芪皂苷类和黄酮类合成的关键基因挖掘及表达量分析[J].山西农业大学学报(自然科学
版),2023,43(3):23-32.
DuanLQ,ChengTY,ZhangTT,etal.Keygenediscoveryandexpressionanalysisofsaponinsandflavonoidbiosynthesisof
Astragalusmembranaceus[J].JournalofShanxiAgriculturalUniversity(NaturalScienceEdition),2023,43(3):23-32.
doi:10.13842/ki.issn1671-8151.202303036
黄芪皂苷类和黄酮类合成的关键基因挖掘及表达量分析
段利强,程天佑,张甜甜,高山*
(山西高等创新研究院,山西太原030032)
摘要:[目的]黄芪作为药食两用的一味中药,其主要活性成包含皂苷,黄酮,多糖等。本文主要探究黄芪的近缘物
种,同时挖掘黄芪活性成分皂苷类和黄酮类合成的关键基因并探究这些关键基因在不同年限的表达变化情况。[方法]
本研究通过高通量转录组学技术对黄芪进行研究。首先利用Trinity对黄芪样本的转录组数据进行拼接以及unigenes
鉴定,然后与物种库进行比对并构建系统发育进化树,明确黄芪的近缘物种。通过RSEM对unigenes进行表达定量,
并利用KEGG和GSEA分析对基因表达谱进行基因功能注释找到黄芪中与皂苷类和黄酮类化合物合成的关键基因,
最后通过RT‐qPCR对相关的关键基因进行验证,进而明确皂苷类和黄酮类化合物合成关键基因在黄芪不同生长年限
的表达情况。[结果]黄芪的近缘物种是鹰嘴豆。GSEA分析得到黄芪中皂苷类合成的关键基因为Unigene0003373和
Unigene0040532,黄酮类合成的关键基因为Unigene0076081和Unigene0027187,且这4个基因的表达量在四年生黄芪
里显著高于1年生黄芪。[结论]Unigene0003373、Unigene0040532、Unigene0076081和Unigene0027187在黄芪皂苷类
和黄酮类合成过程中起关键作用,这为明晰黄芪中皂苷和黄酮合成的关键通路,以及优化黄芪的培育方案奠定了理论
基础。
关键词:黄芪;皂苷;黄酮;转录组;基因表达
中图分类号:R282.6文献标识码:A文章编号:1671-8151(2023)03-0023-10
黄芪为豆科植物蒙古黄芪[A.membranaceus发展已被广泛运用于各个领域[4-5]。转录组学技术
(Fisch.)Bungevar.mongholicus(Bunge)Hsiao]或在中医药领域的运用也日趋体现出其优势,在合
膜荚黄芪[Astragalusmembranaceus(Fisch.)理种植栽培药用植物探究中药药效、作用机制、甚
Bunge]的干燥根,具补气固表,利尿托毒等功能[1]。至针灸等方面发挥重要意义[6-7]。
山西作为黄芪的道地产区,主产地在山西北部恒目前黄芪中关于黄酮类和皂苷类已有较为深
[1-2]
山山脉以及周边县市(广灵、浑源等)。黄芪含入的研究,但主要集中在药效、基源、产地、种植方
有黄酮类、皂苷类、多糖类和氨基酸类等多种
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