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2025年第61卷第06期科学技术
ScienceandTechnology·
陕北白绒山羊绒细度性状全基因组关联分析
1,211122*2*
王凤红,高格,千亿,刘丽娜,朱海鲸,屈雷,张磊
(1.榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000;2.榆林学院陕西省陕北绒山羊工程技术研究中心,陕西榆林719000)
摘要:本文旨在以陕北白绒山羊为研究对象,通过全基因组重测序对陕北白绒山羊绒细度性状开展全基因组
关联分析研究,筛选与绒山羊绒细度性状相关的分子标记及候选基因,为解析绒细度性状的遗传机制及分子
育种提供理论支撑。研究对200只陕北白绒山羊进行10X基因组重测序,使用广义线性模型(GLM)对羊绒
细度性状进行全基因组关联分析(GWAS),并对所获得的SNP位点进行基因注释。结果表明,共筛选到16
个与绒细度性状显著相关的SNP位点,分别在Chr1、Chr2、Chr3、Chr4、Chr5、Chr11、Chr13、Chr16、
Chr18、Chr19、Chr21、Chr27和Chr28上,注释得到S1PR1、DGKB、TMEM106B、LRRIQ1、CPXM1、KCNT2、
CNTNAP4、MYO1D、U6、RASGEF1A、ZNF671、KARS和FXYD4基因。其中,ZNF671、DGKB、KCNT2、
MYO1D和FXYD4可作为陕北白绒山羊绒细度性状的重要候选基因。本研究通过GWAS分析,筛选到一些
与绒细度性状相关的候选基因,为绒细度性状的遗传机理解析奠定基础,也为超细型绒山羊新品系的培育和
实现绒山羊分子标记辅助选择(MAS)提供参考依据。
关键词:全基因组关联分析(GWAS);陕北白绒山羊;绒细度;候选基因
中图分类号S827.2文献标识码ADOI编号10.19556/j.0258-703301
:::
中国是最大的绒山羊饲养国和山羊绒生产国绒山的首要任务
,。
羊种质资源丰富主要有辽宁绒山羊晋岚绒山羊内全基因组关联分析Genome-WideAssociationStudy
,、、(,
蒙古绒山羊河西绒山羊西藏绒山羊四川绒山羊GWAS是在全基因组范围内寻找与动植物重要经济性
、、、、)
山东绒山羊等30多个品种陕北白绒山羊是以辽宁绒状相关联的标记位点通过标记辅助选择进行畜群品种
。,
山羊为父本陕北黑山羊为母本杂交选育20多年而成改良提高生产性能从而提高经济效益目前GWAS
、,。,
的绒肉兼用型品种具有产绒量高耐粗饲耐寒冷已成为家畜群体遗传学研究与重要经济性状基因挖掘的
,、、、
抗风沙抗病力强等特点近年来由于无序杂交改良重要方法之一1996年Risch等[1]首次提出GWAS
、。,,。,
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