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聚丙烯酰胺凝胶电泳实验流程详解
聚丙烯酰胺凝胶电泳(PolyacrylamideGelElectrophoresis,PAGE)是生物化学与分子生物学研究中分离、分析蛋白质和核酸的核心技术之一。其凭借凝胶孔径的可控性、高分辨率及良好的重复性,在蛋白质分子量测定、纯度分析、样品制备等方面发挥着不可替代的作用。本文将从实验原理、试剂准备、操作流程到注意事项进行系统性阐述,旨在为科研工作者提供一份实用且严谨的实验指南。
一、实验原理简述
PAGE的分离基础主要基于样品中各组分的分子量大小、电荷性质及其与凝胶介质的相互作用。聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺单体(Acr)和少量交联剂N,N-亚甲基双丙烯酰胺(Bis)在引发剂(如过硫酸铵,APS)和加速剂(如四甲基乙二胺,TEMED)的作用下聚合交联而成三维网状结构。
在电泳过程中,蛋白质样品在电场作用下向与其所带电荷相反的电极移动。凝胶的分子筛效应使得较小分子更容易穿过凝胶孔隙,迁移速度更快;而较大分子则受到更大阻力,迁移较慢。此外,样品在浓缩胶中还会经历浓缩效应,使样品在进入分离胶前被高度浓缩成一窄带,进一步提高分离效果。通过调节丙烯酰胺和双丙烯酰胺的浓度比例,可以制备不同孔径的凝胶,以适应不同分子量范围样品的分离需求。
二、实验材料与试剂准备
(一)主要仪器设备
垂直板电泳槽及配套电源、制胶模具(玻璃板、间隔条、梳子)、移液器及配套吸头、涡旋混匀器、恒温水浴锅、天平、pH计、磁力搅拌器、凝胶成像系统(后续检测用)。
(二)主要试剂
1.丙烯酰胺(Acr)与N,N-亚甲基双丙烯酰胺(Bis)储存液:通常配制为一定比例的混合液(如30%Acr-Bis,其中Bis占2.6%或1.3%,根据所需凝胶交联度选择),避光4℃保存。丙烯酰胺具有神经毒性,操作时需佩戴手套和口罩,避免吸入。
2.分离胶缓冲液:如Tris-HCl(pH8.8),用于配制分离胶。
3.浓缩胶缓冲液:如Tris-HCl(pH6.8),用于配制浓缩胶。
4.10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液:室温保存,低温易析出,温浴溶解即可。
5.10%过硫酸铵(APS)溶液:临用前新鲜配制,4℃短暂保存。
6.四甲基乙二胺(TEMED):加速凝胶聚合,避光保存。
7.电泳缓冲液:常用Tris-甘氨酸-SDS缓冲液(pH8.3),可配制成浓缩液,使用时稀释。
8.样品上样缓冲液(2×或5×):含SDS、β-巯基乙醇(或DTT)、溴酚蓝(指示剂)、甘油(增加密度),用于样品变性、显色和沉降。
9.蛋白质分子量标准(Marker):根据目标蛋白分子量范围选择合适的Marker。
10.染色液:如考马斯亮蓝R-250染色液。
11.脱色液:通常为水、甲醇(或乙醇)和冰乙酸的混合液。
三、详细实验流程
(一)实验前准备与安全须知
实验开始前,需仔细检查所有试剂是否在有效期内,溶液是否有沉淀、变色等异常。丙烯酰胺单体具有神经毒性,务必在通风橱内操作,佩戴一次性手套、口罩和护目镜。实验台面应保持整洁,移液器、吸头等耗材需洁净。
(二)凝胶的配制与灌制
1.玻璃板的清洗与组装:
用洗涤剂清洗玻璃板,再用自来水冲洗干净,最后用去离子水润洗2-3次,晾干或用无水乙醇擦拭后吹干。将洗净的玻璃板与间隔条按电泳槽说明书要求组装好,确保底部及两侧无渗漏。将组装好的玻璃板模具垂直固定在制胶架上。
2.分离胶的配制与灌制:
根据所需分离胶浓度(如10%、12%),按比例依次在洁净离心管中加入去离子水、30%Acr-Bis储存液、分离胶缓冲液、10%SDS溶液。轻轻混匀后,加入10%APS溶液(用量通常为凝胶总体积的1%左右)和TEMED(用量通常为凝胶总体积的0.1%左右)。TEMED加入后应立即轻轻颠倒混匀(避免剧烈搅拌产生气泡)。
迅速将配制好的分离胶溶液沿玻璃板内壁缓慢注入模具中,直至液面达到距梳齿下方约1.5-2cm处。小心在胶面上覆盖一薄层去离子水或异丙醇(用于隔绝空气,促进凝胶聚合,并使胶面平整)。室温静置待其聚合(通常需30-60分钟)。聚合完成后,可见明显的界面,倾去上层覆盖液,用去离子水洗涤胶面2-3次,用吸水纸吸干残留水分。
3.浓缩胶的配制与灌制:
按比例依次加入去离子水、30%Acr-Bis储存液、浓缩胶缓冲液、10%SDS溶液。轻轻混匀后,加入10%APS溶液和TEMED,混匀方法同分离胶。
将配制好的浓缩胶溶液注入已聚合的分离胶上方,直至液面接近玻璃板顶端。小心插入干净的梳子,避免产生气泡。若有气泡,可轻轻拔出梳子,让少量浓缩胶溶液流出以排除气泡,再重新插入梳子。室温静置待浓缩胶聚合(通常需20-40分钟)。
(三)样品制备与上样
1.样品处理:
将蛋白质样
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