两样本孟德尔随机化法分析1型糖尿病对结直肠癌的影响.pdfVIP

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上海交通大学学报(医学版)

Vol.44No.6Jun.2024755

JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCE)

论著·循证医学

两样本孟德尔随机化法分析1型糖尿病对结直肠癌的影响

俞洋,孟丹,仇奕文,袁见,朱莹杰

上海中医药大学附属龙华医院肿瘤一科,上海200032

[摘要]目的·利用孟德尔随机化法(Mendelianrandomization,MR)研究1型糖尿病与结直肠癌间潜在的因果关系。方

法·采用两样本双向MR分析评估1型糖尿病与结直肠癌的因果关系。研究数据均来自IEUOpenGWASProject数据库。

1型糖尿病的数据集包括患者9266例和对照人群15574例,包含12783129个单核苷酸多态性(singlenucleotide

polymorphism,SNP)的关联分析;结直肠癌的数据集包括患者5657例和对照人群372016例,包含29999696个SNP的

关联分析。筛选工具变量SNP,以逆方差加权(inversevarianceweighted,IVW)法结果作为效应的主要指标,同时将MR-

Egger回归、加权中位数法、基于众数的简单估计、基于众数的加权估计4种方法结果作为参考。采用留一法检验敏感性,

采用IVW法和MR-Egger法进行CochransQ检验判断异质性,MR-pleiotropy函数检验多效性,采用Steiger检验进行方向性

研究。采用共定位分析评估1型糖尿病和结直肠癌之间的效应是否由相同的SNP引起,采用交叉性状连锁不平衡得分回归

(linkagedisequilibriumscoreregression,LDSC)分析2种疾病之间的遗传相关性。所有检验采用R语言软件(4.3.1版本)

执行分析。结果·经筛选后,共采用工具变量(SNP)33个。异质性检验结果发现,SNP之间存在一定的异质性(IVW法

和MR-Egger法结果均P0.05),因此效应评估采用随机效应模型的结果。正向MR分析结果显示,IVW法、MR-Egger法、

加权中位数法、基于众数的加权估计均发现1型糖尿病对结直肠癌存在显著的因果效应(均P0.05);敏感性分析显示,结

果稳定。多效性检验未检测到多效性(P0.05)。Steiger检验发现,1型糖尿病对结直肠癌的效应未受反向作用干扰。反向

MR分析未发现结直肠癌对1型糖尿病存在因果效应(均P0.05)。共定位分析结果显示,H假设概率为45.7%,2种疾病间

4

的因果关系不是由两者基因序列中相同的SNP引起的。LDSC分析显示2种疾病不存在遗传相关性。结论·1型糖尿病可能

促进结直肠癌发生,但结直肠癌对1型糖尿病不存在影响。

[关键词]结直肠癌;1型糖尿病;孟德尔随机化

[DOI]10.3969/j.issn.1674-8115.2024.06.011[中图分类号]R735.3;R587.1[文献标志码]A

Analysisofimpactoftype1diabetesoncolorectalcancerbyusingtwo-sample

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