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生物信息学数据库-遵义医学院珠海校区.ppt

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生物信息学数据库;;NCBI数据库组织;一、NCBI中的生物信息数据库

;8)、Taxonomy:

Genbank中的物种分类学数据库

9)、Structure:分子结构数据库

10)、SNP:单核苷酸多肽性数据库

11)、Books:在线生物医学图书;;例:

在Nucleotide核酸数据库中检索牛冠状病毒的序列信息。

牛冠状病毒bovinecoronavirus;Nucleotide

核苷酸数据库;bovinecoronavirus;牛冠状病毒全基因组;序列存储号;;Graphics格式;DisplaySetting

显示格式;二、序列相似性搜索工具;BLAST:碱基局部对准检索工具

BasicLoculAlignmentSearchTool

可进行核苷酸序列、蛋白质序列方面的同源性分析,能在8秒内在整个DNA数据库中进行序列比较。;入口;;在核苷酸数据库中检索核苷序列;用法学习;检索方法;;;;;检索框:用来粘贴FASTA格式;;粘贴FASTA格式;;比较结果页面;彩色积分图;序列对准描述;三、基因组数据库;;;;;四、OMIM孟德尔人类遗传学数据库;检索框空白,不填入任何内容;;;题名顺序号等位基因的变化;;结果原文;五、Taxonomy---分类学;Taxonomy

入库二;;检索方法;Browser浏览;;系统默认

3级分类级别;点击进入;显示该物种在这些数据库中的文献量;;检索方法;;完整名称

通配符

模糊检索

口语中的名称

分类序号;检索方法;;;六、Structure;Structure;本库工具;Install

安装方法一;;点击下载、安装;检索方法;例:检索PTEN的结构图;;在图上双击,

下边显示对应的内容;谢谢大家!

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