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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库是国际三大核酸序列公共数据库之一?
A.UniProt
B.GenBank
C.STRING
D.PDB
答案:B
解析:国际三大核酸数据库为NCBI的GenBank(美国)、EMBL-EBI的ENA(欧洲)和DDBJ(日本)。UniProt是蛋白质数据库(A错误),STRING是蛋白质互作数据库(C错误),PDB是蛋白质三维结构数据库(D错误)。
用于评估测序数据质量的常用工具是?
A.BWA
B.FastQC
C.GATK
D.Salmon
答案:B
解析:FastQC是专门用于原始测序数据质量评估的工具(如Phred分数、GC含量分布)。BWA用于序列比对(A错误),GATK用于变异检测(C错误),Salmon用于RNA-seq定量(D错误)。
以下哪种测序技术以“长读长”为主要特点?
A.IlluminaHiSeq
B.PacBioSMRT
C.IonTorrent
D.BGIMGISEQ
答案:B
解析:PacBioSMRT(单分子实时测序)和纳米孔测序(如OxfordNanopore)是长读长技术(读长10-100kb)。Illumina、IonTorrent、MGISEQ均为短读长技术(读长50-300bp),故B正确,其余错误。
全基因组关联分析(GWAS)的核心目的是?
A.检测基因表达差异
B.定位与表型相关的遗传变异
C.组装未知物种基因组
D.预测蛋白质三维结构
答案:B
解析:GWAS通过比较病例与对照群体的遗传变异(如SNP),筛选与疾病/性状关联的位点(B正确)。基因表达差异检测是RNA-seq的任务(A错误),基因组组装是三代测序的应用(C错误),蛋白质结构预测依赖AlphaFold等工具(D错误)。
以下哪个工具常用于RNA-seq的差异表达分析?
A.DESeq2
B.BLAST
C.Bowtie2
D.ANNOVAR
答案:A
解析:DESeq2是基于负二项分布模型的RNA-seq差异表达分析工具(A正确)。BLAST用于序列比对(B错误),Bowtie2用于短序列比对(C错误),ANNOVAR用于变异注释(D错误)。
人类参考基因组的最新版本是?
A.hg19
B.GRCh37
C.GRCh38
D.hg38
答案:C
解析:GRCh38(GenomeReferenceConsortiumHumanBuild38)是当前最新的人类参考基因组版本,hg38是其另一种常用简称(但严格来说GRCh38更规范)。hg19/GRCh37是旧版本(A、B错误),D选项表述不严谨(C正确)。
以下哪种变异类型不属于单核苷酸变异(SNV)?
A.C→T
B.G→A
C.A→缺失
D.T→G
答案:C
解析:SNV是单个核苷酸的替换(如C→T、G→A、T→G),而“缺失”属于插入缺失(InDel)(C错误),故正确选项为C。
用于评估基因功能富集的数据库是?
A.dbSNP
B.KEGG
C.TCGA
D.GEO
答案:B
解析:KEGG(京都基因与基因组百科全书)包含通路(Pathway)和功能富集分析工具(B正确)。dbSNP是SNP数据库(A错误),TCGA是癌症基因组数据库(C错误),GEO是基因表达综合数据库(D错误)。
以下哪项不是二代测序(NGS)的特点?
A.高通量
B.短读长
C.单分子测序
D.边合成边测序
答案:C
解析:二代测序(如Illumina)的特点是高通量、短读长、边合成边测序(A、B、D正确)。单分子测序是三代测序(如PacBio)的特点(C错误)。
变异注释中“ExAC”数据库的主要功能是?
A.提供蛋白质结构信息
B.记录人群变异频率
C.预测变异致病性
D.存储癌症体细胞变异
答案:B
解析:ExAC(ExomeAggregationConsortium)是外显子组变异频率数据库,用于评估变异在正常人群中的发生频率(B正确)。蛋白质结构信息来自PDB(A错误),致病性预测工具如SIFT、PolyPhen-2(C错误),癌症体细胞变异来自TCGA(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于三代测序技术的有?
A.IlluminaNovaSeq
B.PacBioSequel
C.OxfordNanoporeMinION
D.IonProton
答案:BC
解析:三代测序技术以长读长、单分子测序为特点,包括PacBioSMRT(B)和OxfordNanopore(C)。Illumina(A)和IonTorre
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