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生物序列相似性分析与种系发生树构建：原理、方法与应用

一、引言

1.1研究背景

自20世纪中叶DNA双螺旋结构被发现以来，生命科学研究进入了分子生物学时代，生物信息学应运而生。随着高通量测序技术的飞速发展，生物序列数据呈指数级增长，这些数据蕴含着丰富的生物学信息，为生命科学研究带来了前所未有的机遇与挑战。生物序列的相似性分析及种系发生树的构建作为生物信息学的核心研究内容，对于揭示生物进化历程、探索物种亲缘关系以及理解生命现象的本质具有不可替代的重要作用。

生物信息学的发展是现代科学技术进步的重要体现。从早期简单的序列存储和检索，到如今复杂的数据分析和模型构建，生物信息学已成为生命科学