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- 2026-01-26 发布于江西
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2024,37(4):27-35中中国国瓜瓜菜菜试验研究
DOI:10.16861/ki.zggc.202423.0652
番茄SlMYB48基因生物信息学及表达分析
12341
刘佳凤,郭晓青,王桂强,王虹云,朱桐,
444411,4
曹守军,姚建刚,张丽莉,张瑞清,赵婧,李涛
(1.烟台大学生命与科学学院山东烟台2640002.烟台市农业技术推广中心山东烟台265499
3.招远市张星镇农业综合服务中心山东招远2654034.山东省烟台市农业科学研究院山东烟台264500)
摘要:MYB转录因子是植物转录因子家族中数量最多、用途最广的成员之一,为挖掘更多番茄(Solanumlycopersi-
cum)MYB转录因子家族成员信息,初步探究其表达模式及功能,以番茄AilsaCraig为试材,采用RT-PCR的方法克
隆SlMYB48基因,并对其进行生物信息学及表达、定位分析。结果表明,番茄SlMYB48基因的开放阅读框(ORF)长
度为708bp,编码235个氨基酸,在番茄的根中表达量最高,叶中次之。SlMYB48蛋白含有保守的MYB结构域,定
位于细胞核中,属于不稳定、亲水性蛋白。对SlMYB48启动子分析,发现其含有大量的逆境响应元件,qRT-PCR及
RNA-seq数据库分析结果表明,高盐、生物逆境胁迫条件下,SlMYB48基因表达量均随处理时间延长而升高,干旱胁
迫条件下表达量下降,推测其可能参与番茄生物及非生物逆境胁迫反应。研究结果为进一步深入探究番茄
SlMYB48基因的功能及作用机制提供了参考。
关键词:番茄;SlMYB48;表达分析;定位
中图分类号:S641.2文献标志码:A文章编号:1673-2871(2024)04-027-09
BioinformaticsandexpressionanalysisoftomatoSlMYB48gene
123414
LIUJiafeng,GUOXiaoqing,WANGGuiqiang,WANGHongyun,ZHUTong,CAOShoujun,YAO
44411,4
Jian’gang,ZHANGLili,ZHANGRuiqing,ZHAOJing,LITao
(1.CollegeofLifeandScience,YantaiUniversity,Yantai264000,Shandong,China;2.YantaiAgriculturalTechnologyExtensionCenter,
Yantai265499,Shandong,China;3.AgriculturalComprehensiveServiceCenter,ZhangxingTown,Zhaoyuan265403,Shandong,China;
4.YantaiAcademyofAgricultural
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