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2026年生物信息学实验室技术员面试问题集

一、基础理论题（共5题，每题6分，总计30分）

1.题目：简述生物信息学中常用的序列比对算法有哪些，并比较它们的优缺点。

答案：生物信息学中常用的序列比对算法主要包括Needleman-Wunsch算法（全局比对）、Smith-Waterman算法（局部比对）和BLAST算法（基于启发式的局部比对）。Needleman-Wunsch算法能够找到两个序列之间最长的匹配区域，但计算复杂度较高，适用于长序列比对。Smith-Waterman算法只比对序列中相似的局部区域，效率更高，但可能忽略全局结构。BLAST算法通过种子匹配和扩展的方式快速找到相似区域，适合大规模序列数据库搜索，但精度可能不如前两者。

解析：考察对序列比对算法的基本理解，需掌握不同算法的适用场景和局限性。

2.题目：解释什么是k-mer，并说明其在基因组组装中的应用。

答案：k-mer是指序列中连续的k个核苷酸或氨基酸残基。在基因组组装中，k-mer被用于将长读段（longreads）拆分成小片段，通过比较这些片段之间的重叠区域，逐步构建出完整的基因组。k-mer的大小会影响组装的灵敏度和准确性，通常选择适中的k值（如50-100）以平衡计算效率和结果质量。

解析：考察对k-mer概念及其应用的理解，需结合实际案例说明。

3.题目：描述生物信息学中常用的文件格式，如FASTA、FASTQ和BAM，并说明它们各自的用途。

答案：FASTA格式用于存储序列数据，以单行描述符和后续的多行序列表示，常用于序列库的存储和交换。FASTQ格式包含序列质量信息，每条序列由四行组成（标识符、序列、+符号、质量值），适用于高throughput测序数据。BAM（BinaryAlignment/Map）是SAM格式的二进制压缩版本，用于存储序列比对结果，效率更高，常用于大规模数据处理。

解析：考察对常用文件格式的掌握，需结合实际应用场景说明。

4.题目：什么是基因表达谱？常用哪些工具进行数据分析？

答案：基因表达谱是记录基因在不同条件下表达水平的数据集合，常用于研究基因功能调控。常用工具包括RNA-Seq分析中的RSEM、Salmon（定量）、edgeR、DESeq2（差异表达分析）和GO/KEGG富集分析工具（功能注释）。

解析：考察对基因表达谱概念和分析流程的理解。

5.题目：简述生物信息学中的机器学习在哪些方面有应用，并举例说明。

答案：机器学习在生物信息学中广泛应用于分类（如癌症诊断）、预测（如药物靶点识别）、序列分析（如蛋白质结构预测）等领域。例如，使用支持向量机（SVM）进行肿瘤亚型分类，或利用深度学习模型预测蛋白质功能。

解析：考察对机器学习在生物信息学中应用的理解，需结合具体案例说明。

二、实验操作题（共4题，每题8分，总计32分）

1.题目：假设你接收到一组未经处理的RNA-Seq数据（FASTQ格式），请列出预处理步骤，并说明每一步的目的是什么。

答案：预处理步骤包括：

-质量控制（QC）：使用FastQC检查原始数据质量，剔除低质量读段。

-修剪（Trimming）：使用Trimmomatic或Cutadapt去除接头序列和低质量碱基。

-过滤（Filtering）：剔除N碱基比例过高或长度不足的读段。

-比对（Alignment）：使用STAR或HISAT2将读段比对到参考基因组。

-定量（Quantification）：使用RSEM或Salmon进行基因表达量计算。

解析：考察对RNA-Seq数据预处理流程的掌握，需结合工具和目的说明。

2.题目：你需要在实验室搭建一个微生物基因组组装流程，请列出关键步骤，并说明如何选择合适的组装软件。

答案：关键步骤包括：

-数据预处理：QC、修剪和过滤。

-k-mer选择：根据测序读段长度和物种复杂性选择合适的k值（如50-150）。

-组装：使用SPAdes或MegaHIT进行组装。

-质量评估：使用QUAST或SPAdes自带的评估工具检查组装质量。

选择软件需考虑物种类型（细菌、古菌或真核生物）、数据类型（短读段或长读段）和计算资源。

解析：考察对基因组组装流程的掌握，需结合实际案例说明。

3.题目：你发现某组实验的蛋白质序列比对结果中，多个序列与已知病毒蛋白高度相似，请简述如何验证这些结果。

答案：验证步骤包括：

-多重序列比对：使用ClustalW或MAFFT进行更精细的比对，确认相似性。

-系统发育树构建：使用MEGA或RAxML构建系统发育树，观察序列间的进化关系。

-功能注释：使用GO或KEGG工具注释蛋白质功能，确认是否为病毒蛋白。

-实验验证：如条件允许，可通过W