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- 2026-02-10 发布于江苏
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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术属于第二代高通量测序(NGS)?
A.PacBioSMRT(单分子实时测序)
B.IlluminaHiSeq(边合成边测序)
C.OxfordNanopore(纳米孔测序)
D.Sanger双脱氧链终止法
答案:B
解析:第二代测序技术(NGS)的核心特点是短读长、高通量、低成本,IlluminaHiSeq采用边合成边测序技术,属于典型NGS平台。A和C是第三代测序(长读长),D是第一代测序技术(Sanger法)。
用于评估基因组组装质量的关键指标是?
A.GC含量
B.N50长度
C.测序深度
D.变异密度
答案:B
解析:N50是组装质量的核心指标,指将所有contig按长度排序后,累计长度达到总长度50%时对应的contig长度,数值越大表示组装连续性越好。GC含量反映基因组碱基组成,测序深度是测序数据量,变异密度是群体遗传指标,均不直接评估组装质量。
以下哪个工具常用于短序列与参考基因组的比对?
A.BLAST
B.BWA
C.Samtools
D.GATK
答案:B
解析:BWA(Burrows-WheelerAligner)是经典的短读长比对工具,适用于Illumina数据与参考基因组的比对。BLAST用于序列相似性搜索,Samtools用于处理SAM/BAM格式文件,GATK用于变异检测,均非比对工具。
人类基因组GRCh38版本属于以下哪类数据库?
A.蛋白质结构数据库(PDB)
B.转录组数据库(GEO)
C.参考基因组数据库(RefSeq)
D.代谢通路数据库(KEGG)
答案:C
解析:GRCh38(GenomeReferenceConsortiumHumanBuild38)是人类参考基因组的官方版本,归属于RefSeq(参考序列数据库)。PDB存储蛋白质三维结构,GEO存储基因表达数据,KEGG存储代谢通路信息。
检测单核苷酸变异(SNV)时,常用的过滤指标不包括?
A.测序深度(Depth)
B.等位基因频率(AF)
C.插入缺失(Indel)长度
D.质量值(QUAL)
答案:C
解析:SNV检测的过滤指标通常包括测序深度(确保覆盖度)、等位基因频率(区分germline/somatic)、质量值(评估变异可信度)。Indel长度是插入缺失变异的特征,与SNV无关。
转录组测序(RNA-seq)中,“FPKM”用于衡量?
A.基因表达量
B.剪接异构体比例
C.测序错误率
D.样本间相关性
答案:A
解析:FPKM(FragmentsPerKilobaseperMillionmappedreads)是标准化的基因表达量计算方法,通过校正基因长度和测序深度,反映基因的转录水平。剪接异构体比例用isoform-level定量(如RSEM),测序错误率通过Q值评估,样本相关性用Pearson相关系数。
预测蛋白质二级结构时,以下哪种方法基于机器学习?
A.Chou-Fasman算法(统计方法)
B.PSIPRED(神经网络)
C.同源建模(Swiss-Model)
D.分子动力学模拟(GROMACS)
答案:B
解析:PSIPRED利用神经网络模型预测蛋白质二级结构(α螺旋、β折叠等),属于机器学习方法。Chou-Fasman基于氨基酸残基的统计偏好,同源建模依赖已知结构模板,分子动力学模拟用于动态分析,均非机器学习。
测序数据质量控制(QC)中,“Phred质量分数Q30”表示?
A.错误率为1%(Q20)
B.错误率为0.1%(Q30)
C.错误率为0.01%(Q40)
D.错误率为10%(Q10)
答案:B
解析:Phred质量分数Q=-10×log??(P),其中P为碱基错误概率。Q30对应P=10?3(0.1%),Q20对应1%,Q40对应0.01%,Q10对应10%。
功能富集分析(GO/KEGG)的核心目的是?
A.识别差异表达基因
B.验证基因互作网络
C.揭示差异基因的共同生物学功能
D.预测基因编码蛋白质的结构
答案:C
解析:功能富集分析通过统计方法(如超几何检验),判断差异基因是否在某些GO术语(生物过程、分子功能)或KEGG通路中显著富集,从而揭示其共同功能。识别差异基因是DESeq2等工具的任务,基因互作网络用STRING数据库,蛋白质结构预测用AlphaFold。
以下哪种算法用于处理高维数据降维?
A.BWT(Burrows-WheelerTransform)
B.PCA(主成分分析)
C.K-means(聚类算法)
D.Smith-Waterman(局部比对)
答案:
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