基于生物信息学分析钙化性主动脉瓣疾病的差异表达基因.pdfVIP

实用心脑肺血管病杂志2025年12月第33卷第12期投稿网址：71·

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·论著·基础研究·

基于生物信息学分析钙化性主动脉瓣疾病的

差异表达基因

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丁姝颖，李小雷，木那瓦尔·克热木，刘芬，李晓梅，迪拉热·阿迪，马依彤

作者单位：1.830000新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，新疆医科大学第一附属医院心脏中心2.442000湖北省十堰市，

湖北医药学院附属国药东风总医院心血管内科

通信作者：马依彤，E-mail：

myt-xj@163.com

【摘要】目的探讨钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）的差异表达基因（DEGs），并采用细胞实验进行验证。

方法本研究时间为2022年12月—2024年6月。从基因表达综合（GEO）数据库下载基因芯片数据集（GSE12644和

GSE83453），共纳入42例样本，其中22例钙化主动脉瓣膜组织为CAVD组，20例正常主动脉瓣膜组织为对照组。使用

seurat包筛选DEGs，使用ClusterProfiler、enrichplot包进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析，构建蛋白质-蛋白质

相互作用（PPI）网络，通过CytoHubba插件筛选出连接度排名前10的关键基因，采用glmnet包进行LASSO回归分析以

确定核心DEGs；采用Cibersort包利用反卷积算法评估22种免疫细胞在主动脉瓣膜组织中的相对浸润比例，使用ggplot2

包可视化展现免疫细胞在CAVD组与对照组中的差异。培养人原代主动脉瓣间质细胞（VICs），分为对照组与CAVD

组，采用qRT-PCR法检测核心DEGsmRNA表达水平。结果共筛选出78个与CAVD相关的DEGs，其中43个表达上调、

35个表达下调。GO功能富集分析结果显示，在生物过程方面，DEGs主要参与细胞外基质（ECM）的组织、胶原纤维

组装和骨化相关通路等；在细胞组成方面，DEGs主要集中在ECM结构、胶原纤维束及钙化结节微环境等；在分子功

能方面，DEGs主要涉及ECM结构成分、整合素结合、Wnt蛋白结合及血小板衍生生长因子结合等；KEGG通路富集分

析结果显示，DEGs主要涉及ECM-受体相互作用、细胞骨架在肌肉中的作用、病灶黏附、蛋白质吸收和消化等。PPI

网络包含56个节点和326条边。LASSO回归分析结果显示，THY1、FOS、MMP9、THBS2、COL5A1、MXRA5是可以预

测或解释CAVD的重要因素。免疫细胞浸润分析结果显示，CAVD组与对照组M0型巨噬细胞、中性粒细胞、浆细胞、

T细胞卵泡辅助细胞、NK细胞表达比较，差异有统计学意义（P＜0.05）。细胞实验结果显示，CAVD组THY1、FOS、

MMP9、THBS2、COL5A1、MXRA5mRNA表达水平高于对照组（P＜0.05）。结论THY1、FOS、MMP9、THBS2、

COL5A1、MXRA5在CAVD中表达升高。

【关键词】主动脉瓣疾病；基因组学；基因

【中图分类号】R542.52【文献标识码】ADOI：10.12114/j.issn.1008-5971.2025.00.271

DifferentiallyExpressedGenesinCalcificAorticValveDiseaseBasedonBioinformaticsAnalysis

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