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刺梨WRKY基因家族鉴定及其在不同组织中的表达分析.pdf

分子植物育种，2024年，第22卷，第4期，第1075-1085页

MolecularPlantBNo.4,1075-1085

研究报告

ResearchReport

刺梨WRKY

基因家族鉴定及其在不同组织中的表达分析

戈23*

田媛13郑锦城

，贵阳，550025

1贵州中医药大学药学院，贵阳，550025;2贵州中医药大学基础医学院，贵阳，550025;3贵州中医药大学药用植物病虫害研究中心

*通信作者，martin1207@126.com

摘要WRKY是植物中一类重要的转录因子，参与植物的生长发育和衰老调控以及响应生物和非生物胁

迫。本研究基于刺梨不同组织的转录组测序数据，鉴定刺梨WRKY家族成员，并分析了家族成员间的进化关

系、受选择压力水平、序列保守结构域特点以及在不同组织中的表达情况。本研究共鉴定58个刺梨WRKY转

录因子，依据拟南芥的分类方法，可分为I(11个)、ⅡI(36个)、Ⅲ(11个)三个家族，Ⅱ家族包含Ⅱa(3个)、ⅡIb

(6个)、IⅡc(13个）、IⅡId(7个)和Ⅱe(7个)五个亚组，RrWRKY58游离在三个家族之外。刺梨58个WRKY蛋

白序列长度介于145~1526aa，分子量介于16.94~172842.37kD之间，等电点介于4.61~9.84。其中RrWR-

KY31、RrWRKY32、RrWRKY47、RrWRKY48和RrWRKY56在WRKY结构域中的保守七肽WRKYGQK处

发生了变异。选择压力分析表明，I组、IⅡI组中IⅡIa和Ⅲ组受到强烈的正选择作用(dn/ds1),而IⅡI组中的IⅡIb、

Ic、IⅡId和Ie均显著受到纯化选择作用(dn/ds1)。通过分析刺梨WRKY基因在茎、叶、花、幼果和成熟果实

中的表达情况，获得的45个基因在5个组织中均有不同程度的表达(TPM0.1)。RrWRKY01、RrWRKY04、

RrWRKY06、RrWRKY12、RrWRKY14和RrWRKY34六个基因在各器官组织中表达量相对较高（TPM20)，

表明这些基因可能参与调控刺梨的茎、叶、花以及果的生长发育过程。在茎中表达丰度高的基因(TPM50)最

WRKY

基因的功能奠定了基础。

关键词刺梨(RosaroxburghiTratt);WRKY;转录因子；系统进化；表达模式

IdentificationandExpressionAnalysisinDifferentTissuesofWRKYTran-

scriptionFactorsinRosaroxburghiiTratt

TianYuan1,32

ZhengJincheng2.3

1CollegeofPharmacy,GuizhouUniversityofTraditionalChineseMedicine,Guiyang,550025;2CollegeofBasicMedicine,GuizhouUniversityof

TraditionalChineseMedicine,Guiyang,550025;3ResearchCenterforMedicinalPlantDiseasesandPestsofGuizhouUniversityofTraditionalChi-

neseMedicine,Guiyang,550025

*Corresin1207@126.com

DOI:10.13271/j.mpb.022.001075

Abstract

WRKYtranscriptionfactorsbelongtoanimportantkindoftranscriptionfactorsinplants,involvedin