(共99页PPT)生物信息学第三讲基因功能富集分析.pptxVIP

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基因功能富集分析;GeneOntology;GO注释涉及140000篇发表文献的实验发现,600000实验支持的GO注释条目。这些作为核心知识,用于其他超过600万来自不同物种的功能注释的推断。

GO联合会(GOConsortium,GOC,;各物种实验验证和非实验验证注释条目的数目;GO类别;GO类别;生物过程:由多个分子一起完成的生物程序、系统的过程。

生物过程通常以其结果或终止状态来描述,例如,细胞分裂的生物学过 程导致从单个母细胞产生两个子细胞(分裂细胞)。

生物过程是由一组特定基因产物(或大分子复合物)所执行的,通常被 高度调节,且在特定的时间点进行。;MolecularFunction Whatdoesitdo?

BiologicalProcess Whatprocessisitinvolvedin?

Cellularponent Wheredoesitact?;;把GO当作图;比如:mitochondrion有2个父节点:organelle(细

胞器)以及cytoplasm(细胞质);而organelle有

2个子节点:mitochondrion,以及organellemembrane

又比如:;GOterms之间的关系;isa和partof

表示子节点所描述的功能、细胞组分或过程从始至终都是属于父节点的,

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